23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1738 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1738  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.887108 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4950  hypothetical protein  65.96 
 
 
63 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.694438  normal  0.307678 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  63.83 
 
 
441 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  63.83 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  63.83 
 
 
441 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  61.7 
 
 
445 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  61.7 
 
 
445 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  61.7 
 
 
445 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0421  hypothetical protein  61.7 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  55.32 
 
 
439 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  55.32 
 
 
439 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  55.32 
 
 
419 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  55.32 
 
 
439 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  55.32 
 
 
439 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3096  transposase Tn5  50 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31320  transposase  51.06 
 
 
460 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12240  transposase  51.06 
 
 
460 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18270  transposase  51.06 
 
 
460 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18340  transposase  51.06 
 
 
460 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33340  transposase  51.06 
 
 
460 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4025  hypothetical protein  48.89 
 
 
470 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4034  hypothetical protein  48.89 
 
 
470 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.287551 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5887  transposase IS4 family protein  48.65 
 
 
481 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000153597 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>