21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6437 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6437  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  258  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8669  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2215  transposase, IS4 family protein  68.12 
 
 		 439 aa  97.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501331  normal  0.787142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2775  transposase, IS4 family protein  68.12 
 
 		 439 aa  97.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055865 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3105  transposase, IS4 family protein  68.12 
 
 		 439 aa  97.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0428603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3107  transposase, IS4 family protein  68.12 
 
 		 419 aa  97.4  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0395714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3660  transposase, IS4 family protein  68.12 
 
 		 439 aa  97.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1413  transposase, IS4 family protein  66.67 
 
 		 462 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.106317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4941  transposase, IS4 family protein  65.22 
 
 		 380 aa  94.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4951  hypothetical protein  62.32 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.248425  normal  0.419329 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4825  hypothetical protein  60.87 
 
 		 441 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4842  hypothetical protein  60.87 
 
 		 445 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4729  hypothetical protein  60.87 
 
 		 445 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.199919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1752  hypothetical protein  60.87 
 
 		 445 aa  85.1  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227885  normal  0.59787 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4752  hypothetical protein  59.42 
 
 		 441 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.839178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4481  hypothetical protein  59.42 
 
 		 441 aa  84  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579978  hitchhiker  0.0000396419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0421  hypothetical protein  58.33 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18270  transposase  38.89 
 
 		 460 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18340  transposase  38.89 
 
 		 460 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308708  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31320  transposase  38.89 
 
 		 460 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33340  transposase  38.89 
 
 		 460 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12240  transposase  37.5 
 
 		 460 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>