More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4272 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014159  Tpau_4272  Integrase catalytic region  100 
 
 		 510 aa  1036    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0581  integrase catalytic subunit  57.87 
 
 		 517 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2756  integrase catalytic subunit  57.87 
 
 		 517 aa  558  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12180  transposase  54.56 
 
 		 488 aa  497  1e-139  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2877  integrase catalytic subunit  35.84 
 
 		 497 aa  204  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3894  integrase catalytic subunit  35.62 
 
 		 498 aa  182  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4006  integrase catalytic subunit  53.29 
 
 		 152 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.031908  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0019  IS21 family transposase  29.5 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0994  IS21 family transposase  29.5 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2921  IS21 family transposase  29.79 
 
 		 390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2228  IS21 family transposase  29.5 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503141  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0036  IS21 family transposase  29.79 
 
 		 390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3370  IS21 family transposase  29.5 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3341  IS21 family transposase  29.79 
 
 		 390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0043  IS21 family transposase  29.79 
 
 		 390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.920387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3888  integrase catalytic region  31.44 
 
 		 427 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5534  integrase catalytic region  31.44 
 
 		 427 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7013  hypothetical protein  31.44 
 
 		 427 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2452  integrase catalytic region  31.44 
 
 		 427 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6916  integrase catalytic region  31.44 
 
 		 427 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2798  integrase catalytic region  31.44 
 
 		 427 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1510  integrase catalytic region  31.44 
 
 		 427 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4700  integrase catalytic region  31.44 
 
 		 427 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.670986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1464  integrase catalytic region  31.44 
 
 		 427 aa  114  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  31.21 
 
 		 429 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  31.21 
 
 		 429 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  31.21 
 
 		 429 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3144  IS2 transposase orfA  29.82 
 
 		 390 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0012  putative transposase  31.91 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.116272 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0099  putative transposase  31.91 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.431039 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  30.53 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  31.87 
 
 		 610 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0786  Integrase catalytic region  29.92 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  30.56 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  30.56 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  30.56 
 
 		 412 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  30.21 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3693  Integrase catalytic region  29 
 
 		 425 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1512  Integrase catalytic region  29 
 
 		 425 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3058  Integrase catalytic region  29 
 
 		 425 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1326  Integrase catalytic region  29 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  28.93 
 
 		 512 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  30.3 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  28.72 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  29.97 
 
 		 504 aa  97.8  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1047  integrase catalytic subunit  26.25 
 
 		 403 aa  96.7  8e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  31.28 
 
 		 449 aa  91.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  31.28 
 
 		 449 aa  91.7  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  30.52 
 
 		 510 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  27.75 
 
 		 410 aa  89.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  28.7 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  28.7 
 
 		 426 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  32.71 
 
 		 515 aa  87.8  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2303  integrase catalytic subunit  32.71 
 
 		 515 aa  87.8  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.268136  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3485  integrase catalytic subunit  32.71 
 
 		 515 aa  87.8  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.522877  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  32.71 
 
 		 515 aa  87.8  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  27.04 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  27.04 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  27.04 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  29.58 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  29.58 
 
 		 434 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  27.04 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  24.16 
 
 		 417 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  27.04 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  27.04 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0097  integrase core subunit  30.58 
 
 		 300 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.368489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  31.84 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  29.69 
 
 		 508 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  29.69 
 
 		 508 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  29.69 
 
 		 508 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  27.79 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  29.13 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  27.79 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  27.79 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  27.79 
 
 		 507 aa  82  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5106  integrase catalytic subunit  28.32 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214322  normal  0.182706 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  27.78 
 
 		 348 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  27.78 
 
 		 340 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  27.78 
 
 		 348 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  26.72 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  27.52 
 
 		 488 aa  78.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  27.08 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  25.72 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  25.72 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  25.72 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  27.08 
 
 		 507 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  26.81 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  28.38 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  28.57 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  28.44 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  28.44 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  28.57 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  28.57 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  28.44 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  28.44 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  28.57 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  28.44 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  28.57 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  28.57 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>