20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4006 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4006  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 152 aa  313  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.031908  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4272  Integrase catalytic region  53.29 
 
 		 510 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0581  integrase catalytic subunit  59.84 
 
 		 517 aa  154  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2756  integrase catalytic subunit  59.84 
 
 		 517 aa  154  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12180  transposase  58.72 
 
 		 488 aa  133  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2877  integrase catalytic subunit  38.17 
 
 		 497 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3894  integrase catalytic subunit  38.17 
 
 		 498 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7081  hypothetical protein  35.25 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  30.11 
 
 		 539 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2539  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 341 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00047026  hitchhiker  0.00000000018385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2586  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 341 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0248633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 341 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 341 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0321  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 341 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0105931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2272  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 341 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0220216  hitchhiker  0.000461104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1789  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 341 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1118  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 341 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  29.47 
 
 		 327 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 509 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  27.83 
 
 		 509 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>