13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7081 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7081  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  657    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2877  integrase catalytic subunit  64.57 
 
 		 497 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3894  integrase catalytic subunit  65.35 
 
 		 498 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484903 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3964  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  49.09 
 
 		 293 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0581  integrase catalytic subunit  35.81 
 
 		 517 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2756  integrase catalytic subunit  35.81 
 
 		 517 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4006  integrase catalytic subunit  35.25 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.031908  normal  0.0146586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2074  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  37.08 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558135  hitchhiker  0.000000114613 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4272  Integrase catalytic region  35.48 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12180  transposase  38.39 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0045  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.34 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0293315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0094  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  27.62 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0745635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3169  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.57 
 
 		 273 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>