More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2272 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  100 
 
 		 539 aa  1102    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  92.35 
 
 		 327 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.87 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.87 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.87 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.63 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  31.63 
 
 		 546 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.08 
 
 		 518 aa  266  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.08 
 
 		 518 aa  266  7e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.18 
 
 		 549 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.33 
 
 		 509 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.66 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.61 
 
 		 518 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.03 
 
 		 487 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.03 
 
 		 487 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.03 
 
 		 487 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.86 
 
 		 520 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.93 
 
 		 562 aa  216  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6768  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.74 
 
 		 501 aa  213  9e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.403374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.91 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3934  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  33.86 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4809  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  33.97 
 
 		 361 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6734  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.45 
 
 		 344 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.37 
 
 		 378 aa  172  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.09 
 
 		 511 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.67 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30.47 
 
 		 353 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  28.33 
 
 		 476 aa  151  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4191  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  33.33 
 
 		 229 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5414  hypothetical protein  29.41 
 
 		 225 aa  94.4  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4192  IS6 family transposase  28.49 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4212  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  31 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1852  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.41 
 
 		 176 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.516656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4192  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.38 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4193  transposase  36 
 
 		 122 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05360  transposase family protein  25.28 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22120  transposase family protein  25.28 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26440  transposase family protein  25.28 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3935  putative transposase  38.95 
 
 		 118 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3476  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.48 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418883  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1834  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.38 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4034  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.35 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3509  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.35 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1816  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.35 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4482  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.35 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2977  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.35 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.69 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0664  ISChy4, transposase  39.58 
 
 		 108 aa  67.8  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.58 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2896  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.58 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1271  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.58 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  42.5 
 
 		 83 aa  67  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0900  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000737646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3481  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0842  transposase  24.24 
 
 		 337 aa  66.6  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0315  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.98 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677908  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2172  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.32 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1940  transposase  26.54 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0399155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0003  transposase  26.54 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0138  transposase  26.07 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0463  transposase  26.54 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0505  transposase  26.54 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0560  transposase  26.54 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1055  transposase  26.07 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1543  transposase  26.54 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1853  transposase  26.54 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2573  ISRSO15-transposase protein  26 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1547  ISRSO15-transposase protein  26 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.355973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1244  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.89 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.661907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1230  ISBma1, transposase, interruption-N  25 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.561116  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0966  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.89 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0650816  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0081  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0229  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.013108  unclonable  1.0640799999999999e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1002  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.692559 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1333  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.38515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1398  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.488423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1978  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00748461  normal  0.0175211 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2160  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00641711 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2654  ISBma1, transposase  25 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2484  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.23891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3003  IS204/IS1001/IS1096/IS1165 transposase  22.59 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1535  ISBma1, transposase  27.03 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1956  isrso15-transposase  25 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2371  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.88 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2438  ISBma1, transposase  25.66 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2639  ISBma1, transposase  25 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3181  ISBma1, transposase  25.66 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1123  ISBma1, transposase  25 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0150  ISBma1, transposase  25.66 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.116574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0351  ISBma1, transposase  25.66 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.215652  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1439  ISBma1, transposase  25.66 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.627971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3383  transposase  23.46 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2902  ISBma1, transposase  25 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2448  transposase  25 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0465  ISBma1, transposase  25.66 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2078  ISBma1, transposase  25.66 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.64027  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3118  ISBma1, transposase  25.66 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.0000000000303493  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3162  ISBma1, transposase  25.66 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2866  ISBma1, transposase  25.66 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0613  ISBma1, transposase  25 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>