37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3935 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3935  putative transposase  100 
 
 		 118 aa  237  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  68.38 
 
 		 518 aa  173  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5414  hypothetical protein  76.7 
 
 		 225 aa  167  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  66.38 
 
 		 520 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.57 
 
 		 518 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.57 
 
 		 518 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.45 
 
 		 546 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.45 
 
 		 546 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.44 
 
 		 549 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3937  hypothetical protein  49.37 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  62.71 
 
 		 562 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4193  transposase  37.04 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  47.95 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  47.95 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  47.95 
 
 		 545 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  47.95 
 
 		 545 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  47.95 
 
 		 545 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  47.95 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.84 
 
 		 378 aa  70.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.4 
 
 		 353 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  38.95 
 
 		 441 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  34.48 
 
 		 509 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3057  transposase  42.5 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4223  insertion element IS466S transposase  40.82 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1852  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.63 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.516656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  38.95 
 
 		 539 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.35 
 
 		 570 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  43.66 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3383  transposase  30.09 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  51.79 
 
 		 511 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3720  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  45.16 
 
 		 186 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7030  transposase  46.43 
 
 		 153 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4643  hypothetical protein  33.06 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5451  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  32.29 
 
 		 536 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.268297 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0984  transposase  35.06 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000283789  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4509  insertion element is466s transposase  58.54 
 
 		 56 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3979  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.71 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>