52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7030 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7030  transposase  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6737  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  46.58 
 
 		 509 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0291676  normal  0.0754692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3980  putative transposase  64.2 
 
 		 83 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  64.2 
 
 		 353 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4193  transposase  61.73 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4138  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  48.1 
 
 		 511 aa  70.9  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.609635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0035  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.56 
 
 		 546 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0088  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  39.56 
 
 		 546 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.0719331 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3262  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.35 
 
 		 518 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00994132 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3281  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  49.35 
 
 		 518 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0194889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4223  insertion element IS466S transposase  45 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3383  transposase  48.28 
 
 		 237 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1852  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.516656  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7841  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50 
 
 		 545 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3974  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  46.43 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8278  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50 
 
 		 545 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8617  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  50 
 
 		 545 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2991  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  51.72 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3101  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  51.72 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4601  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  51.72 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35952  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3814  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.31 
 
 		 549 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6189  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  44.44 
 
 		 562 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.984628  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4953  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.56 
 
 		 518 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4643  hypothetical protein  40.24 
 
 		 280 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  22.83 
 
 		 378 aa  57.4  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3979  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  41.56 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3057  transposase  31.17 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3935  putative transposase  46.43 
 
 		 118 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.89 
 
 		 391 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.89 
 
 		 391 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.89 
 
 		 391 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  54.76 
 
 		 539 aa  52  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3720  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  47.14 
 
 		 186 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4090  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  36.23 
 
 		 441 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0631  transposase  28.17 
 
 		 418 aa  49.7  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0849  transposase  28.17 
 
 		 418 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.414114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1162  transposase  28.17 
 
 		 418 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1556  transposase  28.17 
 
 		 418 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1692  transposase  28.17 
 
 		 442 aa  49.7  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.67531  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0015  transposase  22.94 
 
 		 299 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4509  insertion element is466s transposase  44.68 
 
 		 56 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.282585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0984  transposase  37.74 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000283789  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5033  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  47.92 
 
 		 570 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.681228  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1023  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 		 395 aa  44.3  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0717423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0351  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 		 395 aa  44.3  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.172822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1186  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 		 395 aa  44.3  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1348  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 		 395 aa  44.3  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 		 395 aa  44.3  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.395404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1562  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 		 395 aa  44.3  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0249  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 		 395 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1437  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  30 
 
 		 395 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.12833  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1595  transposase  34.85 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>