261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0664 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0664  ISChy4, transposase  100 
 
 		 108 aa  213  9e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  79.05 
 
 		 413 aa  157  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  40.59 
 
 		 424 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2272  ISL3 family transposase  39.58 
 
 		 539 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00373654  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2360  transposase  33.67 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00308299  hitchhiker  0.00959569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4791  IstB ATP binding domain-containing protein  42.7 
 
 		 284 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0662  integrase catalytic subunit  41.11 
 
 		 495 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102982  hitchhiker  0.000000317754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2239  integrase catalytic subunit  41.11 
 
 		 495 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0237102 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1264  integrase catalytic subunit  42.7 
 
 		 336 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0642781  normal  0.0493016 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0210  transposase, IS21 family  34.04 
 
 		 417 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000847159 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0290  integrase catalytic subunit  41.11 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.196451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0649  integrase catalytic subunit  41.11 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  39.08 
 
 		 476 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.905986  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0046  ISGsu6, transposase OrfA  38.46 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2593  ISGsu6, transposase OrfA  38.46 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.243982  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0020  transposase for insertion sequence  38.89 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1628  transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1183  transposase  38.04 
 
 		 489 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138357 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1441  transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.31725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3951  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3672  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4054  transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3800  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0001  IS21 family transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4125  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.44357  normal  0.500657 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2088  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.207066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1294  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3216  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000564447  normal  0.0522706 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2527  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3336  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0029  IS21 family transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0530  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000118737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2155  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0564082  normal  0.0481856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0136  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0217084 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0077  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0448  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.453908  hitchhiker  0.00000287146 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1049  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0362189  normal  0.0286616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2171  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0335942 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1904  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789725 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2025  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1939  transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0012517  normal  0.673499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0314  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.415268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1305  transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3444  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3393  transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.39722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0634  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0933756  normal  0.145557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2797  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000133045  normal  0.199341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0888  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0176798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1238  transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126413 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0689  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0015  IS21 family transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2905  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00121621  normal  0.994964 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2960  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3154  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2677  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585168  normal  0.0366075 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2586  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00244507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2877  transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3532  transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.0612525 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0098  IS21 family transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.2973499999999993e-20  hitchhiker  2.05788e-63 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3487  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169046 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0036  transposase  38.04 
 
 		 491 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3280  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0112823 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2392  insertion sequence transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.392902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3338  IS100, transposase  38.04 
 
 		 340 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3634  putative transposase  38.04 
 
 		 338 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0020  hypothetical protein  34.78 
 
 		 348 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2884  hypothetical protein  34.78 
 
 		 348 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1563  hypothetical protein  34.78 
 
 		 340 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1047  integrase catalytic subunit  37.8 
 
 		 403 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0321  integrase catalytic subunit  37.36 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0105931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1118  integrase catalytic subunit  37.36 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1789  integrase catalytic subunit  37.36 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2272  integrase catalytic subunit  37.36 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0220216  hitchhiker  0.000461104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2539  integrase catalytic subunit  37.36 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00047026  hitchhiker  0.00000000018385 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2586  integrase catalytic subunit  37.36 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0248633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2797  integrase catalytic subunit  37.36 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3282  integrase catalytic subunit  37.36 
 
 		 341 aa  57.4  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.590315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1079  ISL3 family transposase  36.46 
 
 		 327 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.464356 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0048  IS100 transposase orfA  36.96 
 
 		 340 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3412  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  35.35 
 
 		 353 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.406116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0019  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0055  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0292  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0833  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0865  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1095  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1659  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2321  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000712156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2740  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3013  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0378398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3433  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.45779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3608  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4013  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4269  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4625  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4730  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4769  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5575  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0040  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.348986  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0013  ISPsy4, transposase  39.78 
 
 		 340 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>