More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0638 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  100 
 
 
504 aa  1058    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  53 
 
 
512 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  53 
 
 
512 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  51.6 
 
 
510 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  51.6 
 
 
510 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  51.6 
 
 
510 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  51.6 
 
 
510 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  51.6 
 
 
510 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  51.6 
 
 
510 aa  521  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  50.39 
 
 
507 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  49.2 
 
 
508 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  49.2 
 
 
508 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  49.2 
 
 
508 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  49.75 
 
 
610 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  37.25 
 
 
694 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  34.14 
 
 
531 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4252  Integrase catalytic region  34.41 
 
 
518 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0359  Integrase catalytic region  34.41 
 
 
518 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.694452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1310  Integrase catalytic region  34.41 
 
 
518 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1893  Integrase catalytic region  34.41 
 
 
518 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0009  Integrase catalytic region  34.53 
 
 
523 aa  227  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  32.61 
 
 
507 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  32.61 
 
 
507 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  31.05 
 
 
512 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  31.73 
 
 
513 aa  186  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  31.73 
 
 
513 aa  186  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  31.73 
 
 
513 aa  186  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  31.73 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  31.73 
 
 
475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  31.47 
 
 
513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  31.73 
 
 
513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  31.73 
 
 
513 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  32.4 
 
 
504 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  31.47 
 
 
513 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  32.52 
 
 
510 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  27.47 
 
 
519 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  27.47 
 
 
519 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  27.47 
 
 
519 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  31.76 
 
 
523 aa  179  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0682  Integrase catalytic region  28.37 
 
 
537 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0892  Integrase catalytic region  28.37 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  32.32 
 
 
517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4315  Integrase catalytic region  28.37 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 
514 aa  174  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
514 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
514 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
514 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
514 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
514 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 
514 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  31.66 
 
 
514 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
514 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
514 aa  170  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  31.4 
 
 
514 aa  170  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 
519 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 
519 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 
519 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5628  integrase catalytic region  31.52 
 
 
518 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6206  integrase catalytic region  31.52 
 
 
518 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4730  integrase catalytic region  31.52 
 
 
518 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  30.73 
 
 
517 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0836  integrase catalytic subunit  27.89 
 
 
531 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.649092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1342  integrase catalytic subunit  27.89 
 
 
531 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2443  integrase catalytic subunit  27.89 
 
 
531 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45047  normal  0.859725 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3086  integrase catalytic subunit  27.89 
 
 
531 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0215  Integrase catalytic region  27.34 
 
 
527 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2289  integrase catalytic region  30.94 
 
 
516 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4798  integrase catalytic region  30.94 
 
 
516 aa  163  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288871  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5344  integrase catalytic subunit  27.18 
 
 
523 aa  163  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2788  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.952319  normal  0.0224954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5321  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.354079 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6980  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6805  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3293  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823799  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4234  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115769  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2963  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4851  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3694  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00066117  hitchhiker  0.00045424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2120  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2154  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6163  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0850  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3092  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30832  normal  0.801547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5580  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6473  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3788  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4302  Integrase catalytic region  31.17 
 
 
513 aa  163  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  30.05 
 
 
518 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1795  putative transposase  31.1 
 
 
517 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.765121  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6260  integrase catalytic subunit  31.47 
 
 
517 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.441371  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  26.67 
 
 
528 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  32.48 
 
 
512 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  33.94 
 
 
434 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  33.94 
 
 
434 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1938  integrase catalytic subunit  30.08 
 
 
512 aa  157  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.441696  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4290  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 
512 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.559076  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4396  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 
512 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.624598  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4788  integrase catalytic subunit  30.89 
 
 
512 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1554  Integrase catalytic region  33.83 
 
 
413 aa  154  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3399  integrase catalytic subunit  31.61 
 
 
515 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.976382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>