More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0892 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2443  integrase catalytic subunit  71.35 
 
 		 531 aa  739    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45047  normal  0.859725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4315  Integrase catalytic region  100 
 
 		 537 aa  1111    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3086  integrase catalytic subunit  71.35 
 
 		 531 aa  739    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0682  Integrase catalytic region  99.81 
 
 		 537 aa  1107    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0215  Integrase catalytic region  67.5 
 
 		 527 aa  706    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5344  integrase catalytic subunit  71.21 
 
 		 523 aa  749    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.830623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0892  Integrase catalytic region  100 
 
 		 537 aa  1111    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1342  integrase catalytic subunit  71.35 
 
 		 531 aa  739    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0836  integrase catalytic subunit  71.35 
 
 		 531 aa  739    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.649092 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0638  Integrase catalytic region  28.37 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.316321  normal  0.0202803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1192  Integrase catalytic region  27.35 
 
 		 508 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3857  Integrase catalytic region  27.35 
 
 		 508 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6440  Integrase catalytic region  27.35 
 
 		 508 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000175464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3873  Integrase catalytic region  28.6 
 
 		 531 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464732  normal  0.0452112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6529  Integrase catalytic region  26.36 
 
 		 512 aa  150  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0199  Integrase catalytic region  26.36 
 
 		 512 aa  150  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0240231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1791  putative transposase catalytic subunit  28.41 
 
 		 507 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1310  Integrase catalytic region  29.12 
 
 		 518 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1893  Integrase catalytic region  29.12 
 
 		 518 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0359  Integrase catalytic region  29.12 
 
 		 518 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.694452  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4252  Integrase catalytic region  29.12 
 
 		 518 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0009  Integrase catalytic region  29.07 
 
 		 523 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0018  integrase catalytic region  27.34 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2295  integrase catalytic region  27.34 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2511  integrase catalytic region  27.34 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5653  integrase catalytic region  27.34 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4737  integrase catalytic region  27.34 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6239  integrase catalytic region  27.34 
 
 		 510 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0624  transposase  28.11 
 
 		 610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337489  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13460  transposase  28.27 
 
 		 694 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000225344  hitchhiker  0.00142582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0134  Integrase catalytic region  27.74 
 
 		 507 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.53025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1363  Integrase catalytic region  27.74 
 
 		 507 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9835  transposase  30.46 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0706  integrase catalytic region  27.84 
 
 		 528 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00978905  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1328  integrase catalytic subunit  28.39 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0559  integrase catalytic subunit  27.6 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0376  Integrase catalytic region  27.97 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2305  Integrase catalytic region  27.97 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4138  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 513 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2841  ISPsy14, transposase  26.31 
 
 		 504 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0126762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0136  integrase catalytic subunit  32.27 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0324788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2833  integrase catalytic subunit  32.27 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1250  integrase catalytic subunit  27.75 
 
 		 513 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4229  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 514 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0193  integrase catalytic subunit  28.07 
 
 		 514 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1628  integrase catalytic subunit  28.07 
 
 		 514 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2982  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 514 aa  106  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00424027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3180  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.150597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0410  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0752835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0598  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0997  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1852  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.687265  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2396  integrase catalytic subunit  26.3 
 
 		 514 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483197  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3716  Integrase catalytic region  28.36 
 
 		 523 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.124306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3740  putative transposase  28.17 
 
 		 512 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1811  integrase catalytic subunit  29.28 
 
 		 510 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.14945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2256  integrase catalytic subunit  25.58 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1457  integrase  27.83 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3708  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 513 aa  99.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3187  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 513 aa  99.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0119  Integrase catalytic region  27.72 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1081  Integrase catalytic region  27.72 
 
 		 449 aa  99  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333924  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2548  integrase catalytic subunit  27.55 
 
 		 518 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2660  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 513 aa  99.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.549324  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1865  Integrase catalytic region  29.74 
 
 		 413 aa  99  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0892  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 513 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0988  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 513 aa  99.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1299  integrase catalytic subunit  26.76 
 
 		 513 aa  99.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4128  integrase catalytic subunit  26.56 
 
 		 513 aa  96.7  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1224  integrase catalytic subunit  27.64 
 
 		 513 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2132  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 519 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3016  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 519 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0303  integrase catalytic subunit  25.15 
 
 		 519 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1075  integrase catalytic subunit  27.64 
 
 		 475 aa  94.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2538  integrase catalytic subunit  27.73 
 
 		 424 aa  93.2  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178355  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1554  integrase catalytic subunit  24.04 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2053  integrase catalytic subunit  24.04 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3414  integrase catalytic subunit  24.04 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604761  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1009  integrase catalytic subunit  24.5 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00535974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1319  integrase catalytic subunit  24.5 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2854  integrase catalytic subunit  24.5 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1463  transposase  30.95 
 
 		 487 aa  91.3  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5654  Integrase catalytic region  28.35 
 
 		 512 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01935  hypothetical protein  25.81 
 
 		 510 aa  90.9  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06964  hypothetical protein  25.81 
 
 		 510 aa  90.9  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06058  hypothetical protein  25.81 
 
 		 510 aa  90.9  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00182  transposase  25.96 
 
 		 510 aa  90.1  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  32.16 
 
 		 429 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  32.16 
 
 		 429 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  32.16 
 
 		 429 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1038  integrase catalytic region  27.48 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  27.7 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  27.7 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3717  integrase catalytic subunit  24.22 
 
 		 412 aa  88.6  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6478  Integrase catalytic region  28.31 
 
 		 507 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1052  Integrase catalytic region  28.31 
 
 		 502 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2874  Integrase catalytic region  28.31 
 
 		 502 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4858  Integrase catalytic region  28.31 
 
 		 502 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0252827  normal  0.0109178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4855  Integrase catalytic region  28.31 
 
 		 502 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000769666 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0283  integrase catalytic subunit  26.84 
 
 		 515 aa  87.4  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.188339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>