More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0704 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  100 
 
 
498 aa  1027    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  77.71 
 
 
497 aa  818    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  80.26 
 
 
468 aa  648    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  77.71 
 
 
502 aa  818    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  34.96 
 
 
494 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  34.96 
 
 
494 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  34.96 
 
 
494 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  34.96 
 
 
494 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  33.41 
 
 
442 aa  251  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2311  transposase  54.03 
 
 
273 aa  239  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.280065  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  32.67 
 
 
499 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  32.67 
 
 
499 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  32.67 
 
 
499 aa  239  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3945  transposase  87.3 
 
 
145 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  32.91 
 
 
501 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  32.91 
 
 
501 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  31.81 
 
 
506 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  30.85 
 
 
503 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  30.85 
 
 
503 aa  221  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  30.85 
 
 
503 aa  220  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  31.52 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  31.52 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  31.52 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  31.52 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  31.52 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  32.04 
 
 
497 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  31.52 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  31.52 
 
 
501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2774  transposase  78.95 
 
 
138 aa  216  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.648281  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  32.14 
 
 
501 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  32.56 
 
 
558 aa  206  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
499 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  31.15 
 
 
499 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  34.57 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  34.57 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  34.57 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  34.57 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  32.75 
 
 
505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  32.75 
 
 
505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  30.79 
 
 
499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  30.79 
 
 
499 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  32.75 
 
 
505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  32.75 
 
 
505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  29.53 
 
 
504 aa  200  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  29.53 
 
 
504 aa  200  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  30.87 
 
 
503 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  33.16 
 
 
423 aa  199  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  30.24 
 
 
504 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  30.24 
 
 
504 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  30.24 
 
 
504 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  30.24 
 
 
504 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  30.24 
 
 
504 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  30.24 
 
 
504 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  30.24 
 
 
504 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  30.24 
 
 
504 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  30.24 
 
 
504 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  28.42 
 
 
504 aa  198  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  30.79 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  30.79 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  30.79 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  30.44 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  31.03 
 
 
502 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  31.03 
 
 
502 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  31.03 
 
 
502 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  30.35 
 
 
496 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  30.65 
 
 
502 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  31.61 
 
 
488 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  32.21 
 
 
507 aa  193  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  32.21 
 
 
507 aa  193  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  32.21 
 
 
507 aa  193  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  32.21 
 
 
507 aa  193  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  29.07 
 
 
499 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 
509 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 
509 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  30.45 
 
 
508 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8292  IS21 family transposase  59.04 
 
 
203 aa  186  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  30.25 
 
 
502 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  30.02 
 
 
508 aa  183  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  31.74 
 
 
501 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  31.74 
 
 
501 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  31.74 
 
 
501 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  31.74 
 
 
501 aa  183  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  31.75 
 
 
493 aa  183  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  31.75 
 
 
493 aa  183  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 
510 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 
510 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 
510 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 
510 aa  176  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  29.81 
 
 
508 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  29.81 
 
 
508 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  30.84 
 
 
508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  32.33 
 
 
509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  31.14 
 
 
584 aa  173  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  28.73 
 
 
507 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  31.16 
 
 
534 aa  173  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  31.16 
 
 
534 aa  173  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  29.56 
 
 
501 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  28.84 
 
 
496 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  35.58 
 
 
334 aa  172  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  26.41 
 
 
501 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>