42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8292 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8292  IS21 family transposase  100 
 
 		 203 aa  421  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256876  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  59.04 
 
 		 498 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3945  transposase  70.54 
 
 		 145 aa  165  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2774  transposase  73.74 
 
 		 138 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.648281  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  46.39 
 
 		 502 aa  138  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  45.78 
 
 		 497 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  28.9 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1847  integrase catalytic region  40.86 
 
 		 429 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.154194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1706  integrase catalytic region  40.86 
 
 		 429 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5624  integrase catalytic region  40.86 
 
 		 429 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205652  normal  0.723097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  28.09 
 
 		 534 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  28.09 
 
 		 534 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  28.09 
 
 		 534 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  27.43 
 
 		 565 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  27.43 
 
 		 565 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  27.43 
 
 		 565 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  27.43 
 
 		 565 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  28.57 
 
 		 564 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  26.55 
 
 		 442 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  30.77 
 
 		 493 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  30.77 
 
 		 493 aa  53.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  25.14 
 
 		 584 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  34.58 
 
 		 504 aa  51.6  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  26.63 
 
 		 509 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  34.58 
 
 		 504 aa  51.6  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  29.38 
 
 		 539 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  29.38 
 
 		 555 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  29.21 
 
 		 556 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4913  integrase catalytic subunit  52.94 
 
 		 428 aa  49.7  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279769 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  25.71 
 
 		 494 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  25.71 
 
 		 494 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  25.71 
 
 		 494 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  25.71 
 
 		 494 aa  45.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  29.11 
 
 		 501 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  30.49 
 
 		 501 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  32.95 
 
 		 501 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  32.95 
 
 		 501 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  32.95 
 
 		 501 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  32.95 
 
 		 501 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  25.5 
 
 		 334 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4327  integrase catalytic region  35.59 
 
 		 78 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  29.81 
 
 		 464 aa  41.6  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>