14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4327 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4327  integrase catalytic region  100 
 
 		 78 aa  157  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3945  transposase  44.59 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  47.3 
 
 		 498 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2774  transposase  44.59 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.648281  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  42.31 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  45.95 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  38.81 
 
 		 494 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  38.81 
 
 		 494 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  38.81 
 
 		 494 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  38.81 
 
 		 494 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  34.62 
 
 		 506 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  40 
 
 		 558 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8292  IS21 family transposase  35.59 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  36.23 
 
 		 442 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>