92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2774 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2774  transposase  100 
 
 		 138 aa  289  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.648281  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3945  transposase  92.5 
 
 		 145 aa  231  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  78.95 
 
 		 498 aa  216  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  68.33 
 
 		 497 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  68.33 
 
 		 502 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8292  IS21 family transposase  73.74 
 
 		 203 aa  151  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256876  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  44.44 
 
 		 493 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  44.44 
 
 		 493 aa  82.4  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  41.18 
 
 		 534 aa  76.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  41.18 
 
 		 534 aa  76.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  42.45 
 
 		 534 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  41.28 
 
 		 558 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  32.67 
 
 		 442 aa  72  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  38.4 
 
 		 565 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  38.4 
 
 		 565 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  38.4 
 
 		 565 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  38.4 
 
 		 565 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4327  integrase catalytic region  44.59 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  38.18 
 
 		 539 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  31.78 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  31.78 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  31.78 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  38.18 
 
 		 555 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  31.78 
 
 		 494 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  39.22 
 
 		 556 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  36.73 
 
 		 499 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  36.73 
 
 		 499 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  36.73 
 
 		 499 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  36.36 
 
 		 564 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  35.85 
 
 		 507 aa  63.5  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  35.85 
 
 		 507 aa  63.5  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  35.85 
 
 		 500 aa  62.8  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 		 506 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  35.51 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  37.61 
 
 		 584 aa  58.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  34.07 
 
 		 497 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  37.35 
 
 		 501 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  32.43 
 
 		 504 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  32.43 
 
 		 504 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  36.08 
 
 		 508 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  37.5 
 
 		 503 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  32.43 
 
 		 499 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  32.43 
 
 		 499 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  30.77 
 
 		 504 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  32.43 
 
 		 356 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  32.69 
 
 		 494 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  36.08 
 
 		 508 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  36.08 
 
 		 508 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  31.3 
 
 		 505 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  31.3 
 
 		 505 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  31.3 
 
 		 505 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  31.3 
 
 		 505 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  32 
 
 		 504 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  31.43 
 
 		 501 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  30.43 
 
 		 502 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  31.53 
 
 		 499 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  31.53 
 
 		 499 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  31.53 
 
 		 499 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  34.44 
 
 		 501 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  34.44 
 
 		 501 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  34.44 
 
 		 501 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  34.44 
 
 		 501 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  35.05 
 
 		 508 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  36.14 
 
 		 501 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0664  ISChy4, transposase  33.33 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  47.37 
 
 		 501 aa  47.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  34.48 
 
 		 334 aa  47.4  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  29.09 
 
 		 499 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  29.09 
 
 		 499 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  27.93 
 
 		 496 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  30.77 
 
 		 499 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  29.35 
 
 		 464 aa  45.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  29.35 
 
 		 309 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  29.35 
 
 		 309 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  29.35 
 
 		 309 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  29.35 
 
 		 323 aa  44.7  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  28.23 
 
 		 499 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  32.54 
 
 		 501 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  32.54 
 
 		 501 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1537  hypothetical protein  31.76 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.04 
 
 		 378 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  28.18 
 
 		 509 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  28.18 
 
 		 509 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>