More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3044 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  100 
 
 		 505 aa  1041    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  71.51 
 
 		 508 aa  737    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  100 
 
 		 505 aa  1041    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  100 
 
 		 505 aa  1041    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  69.52 
 
 		 488 aa  674    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  69.02 
 
 		 507 aa  707    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  64.36 
 
 		 508 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  64.36 
 
 		 508 aa  659    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  71.37 
 
 		 509 aa  756    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  71.37 
 
 		 509 aa  756    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  100 
 
 		 505 aa  1041    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  65.01 
 
 		 508 aa  665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  69.02 
 
 		 507 aa  707    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  64.81 
 
 		 508 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  69.02 
 
 		 507 aa  707    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  69.02 
 
 		 507 aa  707    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  60 
 
 		 507 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  50.89 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  50.89 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  50.89 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  50.89 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  50.89 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  50.89 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  50.89 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  51.2 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  51.2 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  51.2 
 
 		 497 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  49.3 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  49.3 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  48.7 
 
 		 502 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  47.11 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  47.11 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  47.31 
 
 		 496 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  46.81 
 
 		 501 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  47.62 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  47.66 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  47.66 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  47.66 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  47.66 
 
 		 510 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  47.62 
 
 		 504 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  44.29 
 
 		 497 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  42.86 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  43.35 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  44.47 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  44.47 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  44.47 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  43.58 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  43.58 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  43.58 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  43.58 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  43.58 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  43.58 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  43.58 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  41.8 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  40.97 
 
 		 499 aa  346  5e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  40.37 
 
 		 499 aa  345  8e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 		 499 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  43.24 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  43.24 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  40.32 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  40.32 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  40.32 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  40.28 
 
 		 499 aa  333  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  40.28 
 
 		 499 aa  333  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  38.69 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  38.69 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  38.69 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  38.69 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  38.69 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  38.69 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  38.69 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  38.69 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  38.69 
 
 		 504 aa  332  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  40.69 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  38.3 
 
 		 506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  45.77 
 
 		 423 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  36.27 
 
 		 503 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  36.27 
 
 		 503 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  36.27 
 
 		 503 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  37.77 
 
 		 503 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  39.84 
 
 		 373 aa  266  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  31.59 
 
 		 494 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  31.59 
 
 		 494 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  31.59 
 
 		 494 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  31.59 
 
 		 494 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  33.33 
 
 		 502 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  33.33 
 
 		 497 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  31.71 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  31.71 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  31.71 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  32.75 
 
 		 498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5105  hypothetical protein  43.4 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  31.04 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  31.13 
 
 		 558 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  28.6 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  28.6 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  32.91 
 
 		 509 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  32.84 
 
 		 468 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>