More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3204 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  69.72 
 
 
503 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  69.72 
 
 
503 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  100 
 
 
501 aa  1033    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  100 
 
 
501 aa  1033    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  100 
 
 
501 aa  1033    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  100 
 
 
501 aa  1033    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  100 
 
 
501 aa  1033    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  100 
 
 
501 aa  1033    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  100 
 
 
501 aa  1033    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  69.57 
 
 
497 aa  692    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  69.57 
 
 
497 aa  692    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  69.57 
 
 
497 aa  692    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  56.29 
 
 
502 aa  565  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  55.94 
 
 
501 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  56.57 
 
 
496 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  56.57 
 
 
496 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  56.57 
 
 
496 aa  558  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2113  Integrase catalytic region  55.51 
 
 
503 aa  539  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 
510 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 
510 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 
510 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  53.51 
 
 
510 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  54.12 
 
 
504 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  53.61 
 
 
508 aa  514  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  51.79 
 
 
509 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  51.79 
 
 
509 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  51.88 
 
 
508 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  51.68 
 
 
508 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 
508 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 
508 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  50.89 
 
 
505 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  50.89 
 
 
505 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  50.89 
 
 
505 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  50.89 
 
 
505 aa  486  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  50.98 
 
 
507 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  50.98 
 
 
507 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  50.98 
 
 
507 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  50.98 
 
 
507 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  49.2 
 
 
507 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
488 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  43.89 
 
 
497 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  42.14 
 
 
506 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  41.7 
 
 
504 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  41.7 
 
 
504 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  41.7 
 
 
504 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  41.7 
 
 
504 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  41.7 
 
 
504 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  41.7 
 
 
504 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  41.7 
 
 
504 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  41.7 
 
 
504 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  41.7 
 
 
504 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  40.94 
 
 
503 aa  360  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  42.18 
 
 
501 aa  354  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  42.18 
 
 
501 aa  354  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  41.9 
 
 
499 aa  349  8e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  43.46 
 
 
502 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  43.46 
 
 
502 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  43.46 
 
 
502 aa  346  5e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  40.76 
 
 
503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  40.76 
 
 
503 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  40.76 
 
 
503 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  42.74 
 
 
501 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  41.09 
 
 
499 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  41.09 
 
 
499 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  41.09 
 
 
499 aa  340  4e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  40.89 
 
 
499 aa  339  7e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  40.89 
 
 
499 aa  339  7e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  40.28 
 
 
499 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  40.28 
 
 
499 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  41.62 
 
 
502 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 
501 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 
501 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 
501 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 
501 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 
501 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 
501 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  41.87 
 
 
501 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  40.64 
 
 
496 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  42.43 
 
 
504 aa  335  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  42.43 
 
 
504 aa  335  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  39.88 
 
 
499 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4982  integrase catalytic subunit  46.02 
 
 
423 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  42.82 
 
 
373 aa  281  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  30.58 
 
 
494 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  30.58 
 
 
494 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  30.58 
 
 
494 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  30.58 
 
 
494 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  31.4 
 
 
442 aa  203  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5105  hypothetical protein  44.21 
 
 
290 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  29.9 
 
 
504 aa  196  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  31 
 
 
499 aa  191  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  31 
 
 
499 aa  191  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  31 
 
 
499 aa  191  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  31.32 
 
 
497 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  31.1 
 
 
502 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  43.27 
 
 
356 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  29.33 
 
 
498 aa  164  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  27.62 
 
 
504 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  27.62 
 
 
504 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  30.9 
 
 
509 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>