More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3264 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3264  transposase  100 
 
 
509 aa  1020    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  50.99 
 
 
565 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  49.26 
 
 
558 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  50.99 
 
 
565 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  50.99 
 
 
565 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  50.99 
 
 
565 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  52.34 
 
 
534 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  52.34 
 
 
534 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  51.94 
 
 
555 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  51.85 
 
 
556 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  52.15 
 
 
534 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  51.2 
 
 
564 aa  463  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  49.45 
 
 
584 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  51.24 
 
 
539 aa  442  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  37.9 
 
 
499 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  37.9 
 
 
499 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  37.9 
 
 
499 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  34.06 
 
 
494 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  34.06 
 
 
494 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  34.06 
 
 
494 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  34.06 
 
 
494 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  35.9 
 
 
442 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  31.06 
 
 
497 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  30.47 
 
 
504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  30.47 
 
 
504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  31.05 
 
 
502 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  30.8 
 
 
501 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  30.8 
 
 
501 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  30.8 
 
 
501 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  30.8 
 
 
501 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  31.38 
 
 
497 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  29.63 
 
 
506 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  30.43 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  30.43 
 
 
503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  32.33 
 
 
498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  31.71 
 
 
508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  30.23 
 
 
503 aa  174  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  31.99 
 
 
501 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  30.38 
 
 
508 aa  171  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  30.19 
 
 
508 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  30.09 
 
 
504 aa  165  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  35.51 
 
 
334 aa  163  8.000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  30.04 
 
 
507 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  30.9 
 
 
501 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  30.9 
 
 
501 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  30.9 
 
 
501 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  30.9 
 
 
501 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  30.9 
 
 
501 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  30.9 
 
 
501 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  30.9 
 
 
501 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  32.91 
 
 
505 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  32.91 
 
 
505 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  32.91 
 
 
505 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  32.91 
 
 
505 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  29.96 
 
 
509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  29.96 
 
 
509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
504 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
504 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
504 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
504 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
504 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
504 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
504 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
504 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
504 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0300  transposase  27.35 
 
 
529 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  32.01 
 
 
373 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  30.06 
 
 
501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  33.7 
 
 
464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  32.16 
 
 
503 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  27.68 
 
 
501 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  32.72 
 
 
501 aa  145  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  28.35 
 
 
502 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  34.08 
 
 
494 aa  145  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  29.79 
 
 
507 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  29.79 
 
 
507 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  29.25 
 
 
499 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  29.25 
 
 
499 aa  144  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  29.79 
 
 
507 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  29.79 
 
 
507 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  29.77 
 
 
508 aa  143  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  28.13 
 
 
496 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  27.93 
 
 
496 aa  140  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  27.93 
 
 
496 aa  140  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  28.26 
 
 
499 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  28.26 
 
 
499 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  28.26 
 
 
499 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  28.66 
 
 
499 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  29.53 
 
 
488 aa  139  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  27.82 
 
 
502 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  31.49 
 
 
497 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  31.49 
 
 
497 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  31.49 
 
 
497 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  38.96 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  38.96 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  38.96 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3052  integrase catalytic subunit  29.77 
 
 
504 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  33.9 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  32.72 
 
 
501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>