More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2749 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1047    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  45.4 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  45.4 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  46.4 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  46.4 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  46.4 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  46.4 
 
 		 501 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  35.56 
 
 		 494 aa  262  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  32.21 
 
 		 493 aa  249  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  32.21 
 
 		 493 aa  249  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  35.68 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1802  transposase  34.13 
 
 		 464 aa  246  8e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.716345  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  31.56 
 
 		 501 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1799  transposase  31.24 
 
 		 507 aa  219  6e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.161181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1412  transposase  30.63 
 
 		 507 aa  216  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0995  transposase  31.39 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1659  transposase  37.62 
 
 		 323 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  33.09 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0706  transposase  38.49 
 
 		 309 aa  210  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0028  transposase  38.14 
 
 		 309 aa  207  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0314  transposase  38.14 
 
 		 309 aa  207  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00173653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  29.21 
 
 		 494 aa  192  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  29.21 
 
 		 494 aa  192  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  29.21 
 
 		 494 aa  192  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  29.21 
 
 		 494 aa  192  9e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2954  hypothetical protein  57.52 
 
 		 160 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  31.23 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  31.23 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  31.23 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  29.05 
 
 		 502 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  28.83 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  31.99 
 
 		 509 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  26.41 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  29.16 
 
 		 534 aa  160  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  29.16 
 
 		 534 aa  160  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  29.16 
 
 		 534 aa  160  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  28.53 
 
 		 565 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  28.53 
 
 		 565 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  28.53 
 
 		 565 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  28.53 
 
 		 565 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  26.43 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  27.76 
 
 		 558 aa  150  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  28.35 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  28.17 
 
 		 555 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2530  IstA2  28.17 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000787231  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  27.76 
 
 		 584 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0683  transposase  25.91 
 
 		 504 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  25.15 
 
 		 496 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  24.95 
 
 		 496 aa  136  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5139  hypothetical protein  27 
 
 		 468 aa  136  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235994  normal  0.315254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  24.95 
 
 		 496 aa  136  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  25.1 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  24.13 
 
 		 497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  24.13 
 
 		 497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  24.13 
 
 		 497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  26 
 
 		 509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  27.39 
 
 		 564 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  23.81 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  25.48 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  25.48 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  25.48 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  25.48 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  23.53 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  25.27 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0739  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.281393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0831  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1214  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3099  integrase catalytic subunit  25.64 
 
 		 510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5321  ISPsy20, transposase IstA  25.3 
 
 		 501 aa  121  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  25.18 
 
 		 508 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  25.18 
 
 		 508 aa  121  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  24.46 
 
 		 503 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  24.41 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  24.41 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  25.44 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  25.44 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  25.44 
 
 		 503 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  23.65 
 
 		 507 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  24.68 
 
 		 508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  24.18 
 
 		 508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  25.57 
 
 		 508 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  23.72 
 
 		 504 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3403  IS21 family transposase  25.78 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  25.78 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>