More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2077 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  100 
 
 
356 aa  734    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  90.61 
 
 
499 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  90.61 
 
 
499 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  90.61 
 
 
499 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  89.15 
 
 
499 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  89.15 
 
 
499 aa  395  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1039  Integrase catalytic region  89.52 
 
 
496 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0651609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  87.79 
 
 
499 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  87.79 
 
 
499 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  77.46 
 
 
499 aa  347  2e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  72.64 
 
 
499 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0788  IstB-like ATP-binding protein  94.52 
 
 
287 aa  292  5e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.867709  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0900  IstB-like ATP-binding protein  93.84 
 
 
287 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.704977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1203  IstB-like ATP-binding protein  93.84 
 
 
287 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3715  IstB-like ATP-binding protein  93.84 
 
 
287 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0319  IstB-like ATP-binding protein  93.84 
 
 
287 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791653  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3913  IstB-like ATP-binding protein  93.84 
 
 
287 aa  290  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.668186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  64.45 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  64.45 
 
 
501 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  62.26 
 
 
501 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1038  IstB domain protein ATP-binding protein  84.25 
 
 
287 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3924  IstB-like ATP-binding protein  88.89 
 
 
287 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  61.79 
 
 
502 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3044  IstB-like ATP-binding protein  84.93 
 
 
287 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3057  IstB-like ATP-binding protein  84.93 
 
 
287 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.965627  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0433  integrase catalytic subunit  58.33 
 
 
504 aa  248  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.230494  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0850  integrase catalytic subunit  58.33 
 
 
504 aa  248  8e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.314158  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2842  IstB-like ATP-binding protein  76.22 
 
 
168 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419831  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3483  integrase catalytic subunit  53.99 
 
 
501 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5130  integrase catalytic subunit  53.99 
 
 
501 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.819554  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0908  integrase catalytic subunit  53.99 
 
 
501 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5140  integrase catalytic subunit  53.99 
 
 
501 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.920886  normal  0.438385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2463  integrase catalytic subunit  53.99 
 
 
501 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.587911  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3053  integrase catalytic subunit  53.99 
 
 
501 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3390  integrase catalytic subunit  53.99 
 
 
501 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0417622 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5400  integrase catalytic region  54.67 
 
 
502 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4173  integrase catalytic region  54.67 
 
 
502 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2255  integrase catalytic region  54.67 
 
 
502 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.659658  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  48.57 
 
 
503 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  48.57 
 
 
503 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  48.57 
 
 
503 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  50.7 
 
 
506 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  49.77 
 
 
504 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  49.77 
 
 
504 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  49.77 
 
 
504 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  49.77 
 
 
504 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  49.77 
 
 
504 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  49.77 
 
 
504 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  49.77 
 
 
504 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  49.77 
 
 
504 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  49.77 
 
 
504 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  50.94 
 
 
497 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  49.3 
 
 
503 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  47.89 
 
 
373 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1108  IstB domain protein ATP-binding protein  84.47 
 
 
242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6518  IstB ATP binding domain-containing protein  79.61 
 
 
244 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.105365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2497  ATPase  79.61 
 
 
217 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5110  hypothetical protein  53.98 
 
 
199 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122941  normal  0.136795 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0553  IstB ATP binding domain-containing protein  79.61 
 
 
242 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.668205  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0565  IstB ATP binding domain-containing protein  79.61 
 
 
242 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0923407  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0909  IstB ATP binding domain-containing protein  77.45 
 
 
242 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5131  IstB ATP binding domain-containing protein  77.45 
 
 
242 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.701045  normal  0.85319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3391  IstB ATP binding domain-containing protein  77.45 
 
 
242 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0313993 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4981  IstB ATP binding domain-containing protein  77.45 
 
 
242 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  77.45 
 
 
242 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2464  IstB ATP binding domain-containing protein  77.45 
 
 
242 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.938722  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3052  IstB ATP binding domain-containing protein  77.45 
 
 
242 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043848 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0432  IstB-like ATP-binding protein  77.45 
 
 
242 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0234924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0849  IstB-like ATP-binding protein  77.45 
 
 
242 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.152009  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5399  IstB ATP binding domain-containing protein  75.73 
 
 
242 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2254  IstB ATP binding domain-containing protein  75.73 
 
 
242 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4172  IstB ATP binding domain-containing protein  75.73 
 
 
242 aa  179  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0040  IstB domain protein ATP-binding protein  74.76 
 
 
243 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.792091  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1435  IstB domain protein ATP-binding protein  63.71 
 
 
245 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1293  IstB domain protein ATP-binding protein  63.71 
 
 
245 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0907  IstB domain protein ATP-binding protein  63.71 
 
 
245 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0017  IstB domain protein ATP-binding protein  63.71 
 
 
245 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  63.71 
 
 
245 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2180  IstB domain protein ATP-binding protein  63.71 
 
 
245 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2256  IstB domain protein ATP-binding protein  63.71 
 
 
245 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0885  IstB domain protein ATP-binding protein  63.71 
 
 
245 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2847  IstB domain protein ATP-binding protein  63.71 
 
 
245 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0070  IstB domain protein ATP-binding protein  72.82 
 
 
243 aa  175  8e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.166344  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5104  IstB ATP binding domain-containing protein  74.51 
 
 
242 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.34332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1070  Integrase catalytic region  41.3 
 
 
496 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.47791  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2408  Integrase catalytic region  41.3 
 
 
496 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3173  Integrase catalytic region  41.3 
 
 
496 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2885  IstB domain protein ATP-binding protein  68.93 
 
 
245 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.46368e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4065  IstB domain protein ATP-binding protein  68.93 
 
 
245 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2411  IstB domain protein ATP-binding protein  68.93 
 
 
245 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.11316 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2721  IstB ATP binding domain-containing protein  71.84 
 
 
140 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000844746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  65.09 
 
 
245 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0070  transposase  43.75 
 
 
503 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.177477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4455  putative transposase  43.75 
 
 
503 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2865  IstB domain protein ATP-binding protein  67.31 
 
 
247 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0985234  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3373  IstB ATP binding domain-containing protein  89.16 
 
 
85 aa  166  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.748723  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4687  IstB domain protein ATP-binding protein  62.3 
 
 
261 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.212682  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  62.3 
 
 
261 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1465  putative transposase  60.58 
 
 
277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2996  putative transposase  60.58 
 
 
277 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>