101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1537 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1537  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  322  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1016  IstA2  85.39 
 
 		 499 aa  154  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.133303 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1175  IstA2  85.39 
 
 		 499 aa  154  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0070794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1501  IstA2  85.39 
 
 		 499 aa  154  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0307163  hitchhiker  0.000409094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4458  transposase  43.33 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000107543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2875  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 506 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00853486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3264  transposase  35.42 
 
 		 509 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354242  normal  0.73638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0221  transposase  40.23 
 
 		 565 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113746  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1871  transposase  40.23 
 
 		 565 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3017  transposase  40.23 
 
 		 565 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3226  transposase  40.23 
 
 		 565 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2004  transposase  32.26 
 
 		 494 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2198  transposase  32.26 
 
 		 494 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2294  transposase  32.26 
 
 		 494 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2831  transposase  32.26 
 
 		 494 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0458  transposase  39.53 
 
 		 584 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2866  Integrase catalytic region  27.27 
 
 		 503 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00185303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1541  hypothetical protein  58.7 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.299342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1780  transposase  38.37 
 
 		 558 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.466747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2749  hypothetical protein  31.46 
 
 		 501 aa  52.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.596289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0016  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 504 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0423553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0886  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 504 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.106081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0906  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 504 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1294  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 504 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1436  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 504 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2179  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 504 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2255  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 504 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2848  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 504 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3489  Integrase catalytic region  30.39 
 
 		 504 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0483  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 		 508 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3365  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 		 508 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0823  hypothetical protein  33.33 
 
 		 504 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 504 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4688  Integrase catalytic region  31.96 
 
 		 508 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1464  putative transposase  37.35 
 
 		 497 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2997  putative transposase  37.35 
 
 		 497 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3304  putative transposase  37.35 
 
 		 497 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.299203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1227  Integrase catalytic region  34.69 
 
 		 497 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1971  integrase catalytic subunit  36.54 
 
 		 373 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0139673  normal  0.752349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0069  Integrase catalytic region  32.35 
 
 		 502 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.83421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3067  hypothetical protein  33.01 
 
 		 501 aa  50.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2412  Integrase catalytic region  31.03 
 
 		 503 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2884  Integrase catalytic region  31.03 
 
 		 503 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.53685e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4066  Integrase catalytic region  31.03 
 
 		 503 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4958  transposase  38.36 
 
 		 502 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4983  transposase  38.36 
 
 		 497 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.712907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1042  Integrase catalytic region  31.96 
 
 		 508 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.861303  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0901  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 499 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0261682  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3714  integrase catalytic subunit  33.33 
 
 		 499 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.16715  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0417  integrase catalytic subunit  30.34 
 
 		 509 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.377294 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1251  integrase catalytic subunit  30.34 
 
 		 509 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.539956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2738  Integrase catalytic region  32.22 
 
 		 501 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0704  integrase catalytic region  33.73 
 
 		 498 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275152  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3045  IstA2  35.96 
 
 		 534 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000242102  hitchhiker  0.00242323 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5335  IstA2  35.96 
 
 		 534 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0155  transposase IstA for insertion sequence IS1326  31.13 
 
 		 507 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.791462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2556  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 501 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2899  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 501 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4866  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 501 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4956  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 501 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0004  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 501 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3204  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 501 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3299  integrase catalytic subunit  29.89 
 
 		 501 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0041  Integrase catalytic region  31.37 
 
 		 501 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.456904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3668  IstA2  35.05 
 
 		 564 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0182144  normal  0.155285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2077  IstB-like ATP-binding protein  30.39 
 
 		 356 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0318  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 		 499 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0789  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 		 499 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.972954  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3914  integrase catalytic subunit  32.22 
 
 		 499 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0024  transposase (25)  31.52 
 
 		 501 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0619695  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0485  transposase (25)  31.52 
 
 		 501 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1288  transposase (25)  31.52 
 
 		 501 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.540829  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  45.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2218  transposase (25)  31.52 
 
 		 501 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3235  integrase catalytic subunit  31.25 
 
 		 508 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03390  transposase  25.69 
 
 		 494 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3656  IstA2  33.73 
 
 		 556 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4517  IstA2  33.73 
 
 		 555 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2079  IstA2  34.88 
 
 		 534 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  hitchhiker  0.00457727 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2774  transposase  31.76 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.648281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3045  integrase catalytic subunit  31.11 
 
 		 499 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3056  integrase catalytic subunit  31.11 
 
 		 499 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.278904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3923  integrase catalytic subunit  27.45 
 
 		 499 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3945  transposase  31.4 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0482  integrase catalytic subunit  38.16 
 
 		 419 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.239573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2245  IS1533 transposase  38.67 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0270795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6519  integrase catalytic region  32.22 
 
 		 499 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126482 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0315  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 507 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.0795408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0648  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 488 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.509934 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0675  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 507 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.275744  hitchhiker  0.000336572 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1791  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 507 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.459924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2677  Integrase catalytic region  33.33 
 
 		 507 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0554  integrase catalytic region  33.77 
 
 		 501 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0566  integrase catalytic region  33.77 
 
 		 501 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.478269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0130  transposase  28.89 
 
 		 502 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1643  transposase  28.95 
 
 		 493 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1657  transposase  28.95 
 
 		 493 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0683  IS21 family transposase  32.18 
 
 		 505 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1639  IS21 family transposase  32.18 
 
 		 505 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3044  IS21 family transposase  32.18 
 
 		 505 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>