More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3900 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  99.42 
 
 		 517 aa  1039    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  99.81 
 
 		 517 aa  1043    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  72.37 
 
 		 515 aa  723    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  99.81 
 
 		 517 aa  1043    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  99.81 
 
 		 517 aa  1043    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  99.81 
 
 		 517 aa  1043    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  71.84 
 
 		 515 aa  723    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 517 aa  1044    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  99.61 
 
 		 517 aa  1040    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  99.81 
 
 		 517 aa  1043    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  99.81 
 
 		 517 aa  1043    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  99.61 
 
 		 517 aa  1040    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  72.04 
 
 		 515 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  72.04 
 
 		 515 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  72.04 
 
 		 515 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  72.04 
 
 		 515 aa  724    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  99.81 
 
 		 517 aa  1043    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  73.59 
 
 		 515 aa  743    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  73.59 
 
 		 515 aa  743    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  73.59 
 
 		 515 aa  743    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  59.38 
 
 		 453 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  47.22 
 
 		 508 aa  411  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  46.53 
 
 		 508 aa  404  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 508 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 508 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  31.07 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  31.07 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  31.9 
 
 		 576 aa  172  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4652  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  61.54 
 
 		 500 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.801601  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  27.25 
 
 		 566 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  29.96 
 
 		 559 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  27.25 
 
 		 566 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  27.25 
 
 		 566 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  29.09 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  29.09 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  29.09 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  29.09 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  29.09 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  26.26 
 
 		 558 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  26.26 
 
 		 558 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  25.87 
 
 		 551 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  25.87 
 
 		 569 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  25.87 
 
 		 551 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  26.34 
 
 		 559 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  27.82 
 
 		 554 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  26.29 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  26.29 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  26.29 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  26.29 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  26.29 
 
 		 585 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  23.38 
 
 		 559 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  23.38 
 
 		 594 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  23.76 
 
 		 522 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  28.57 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  27.8 
 
 		 680 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3468  hypothetical protein  68.63 
 
 		 106 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  24.39 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  24.39 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  23.36 
 
 		 575 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  30.82 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  23.83 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  27.89 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  24.19 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  29.88 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  29.47 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  29.47 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  21.86 
 
 		 513 aa  62.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  26.15 
 
 		 502 aa  62  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  31.05 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  31.21 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  30.32 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  28.34 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  33.17 
 
 		 481 aa  57  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  32.91 
 
 		 352 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  32.69 
 
 		 481 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  32.14 
 
 		 351 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  31.38 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  25.62 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  28.19 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  28.19 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  27.94 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  27.94 
 
 		 478 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0420  hypothetical protein  28.68 
 
 		 246 aa  54.3  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  28.74 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  21.11 
 
 		 406 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>