117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0852 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  87.76 
 
 		 442 aa  648    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  79.79 
 
 		 483 aa  715    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  80.5 
 
 		 490 aa  744    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1112    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  44.81 
 
 		 569 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  44.81 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  44.81 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  44.22 
 
 		 559 aa  461  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  44.22 
 
 		 594 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  48.43 
 
 		 558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  48.43 
 
 		 558 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  44.57 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  44.57 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  44.57 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  43.92 
 
 		 522 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  45.77 
 
 		 553 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  45.77 
 
 		 553 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  45.77 
 
 		 553 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  45.77 
 
 		 553 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  45.77 
 
 		 553 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  43.56 
 
 		 559 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  47.42 
 
 		 559 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  41.37 
 
 		 511 aa  361  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  44.92 
 
 		 502 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  42.86 
 
 		 424 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  40.04 
 
 		 585 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  40.04 
 
 		 585 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  40.04 
 
 		 585 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  40.04 
 
 		 585 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  40.04 
 
 		 585 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  44.09 
 
 		 406 aa  340  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  41.82 
 
 		 680 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  47.57 
 
 		 352 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  46.42 
 
 		 272 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  41.55 
 
 		 223 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  40.13 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  85.56 
 
 		 106 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  84.44 
 
 		 106 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  83.33 
 
 		 106 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1874  hypothetical protein  35.81 
 
 		 229 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  24.95 
 
 		 518 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  24.95 
 
 		 518 aa  100  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  28.04 
 
 		 515 aa  98.6  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  27.09 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  27.09 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  27.09 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  27.09 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  27.09 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  27.09 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  27.09 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  27.09 
 
 		 517 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  27.09 
 
 		 517 aa  97.4  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  28.04 
 
 		 515 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  28.04 
 
 		 515 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  28.04 
 
 		 515 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  28.04 
 
 		 515 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  27.09 
 
 		 517 aa  97.4  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  51.55 
 
 		 97 aa  96.7  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  26.89 
 
 		 517 aa  95.1  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  28.37 
 
 		 515 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  28.37 
 
 		 515 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  28.37 
 
 		 515 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 		 508 aa  88.6  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 		 508 aa  87.8  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 		 508 aa  87.8  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 		 508 aa  87.8  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 		 508 aa  87.8  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  25.69 
 
 		 508 aa  87.8  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  25.74 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  46.99 
 
 		 83 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 		 515 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  25.71 
 
 		 576 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  50.56 
 
 		 140 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  27.88 
 
 		 575 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  24.38 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1900  transposase  55.74 
 
 		 72 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  32.5 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  29.2 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1876  putative transposase  33.33 
 
 		 305 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  29.03 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  29.03 
 
 		 368 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6786  transposase IS4 family protein  28.23 
 
 		 368 aa  51.2  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  23.46 
 
 		 458 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  31.82 
 
 		 368 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7064  hypothetical protein  29.84 
 
 		 97 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.124079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  20.15 
 
 		 548 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  20.15 
 
 		 548 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  20.15 
 
 		 548 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>