More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2286 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  100 
 
 		 576 aa  1161    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 		 518 aa  211  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 		 518 aa  211  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 		 515 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  31.99 
 
 		 515 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  31.99 
 
 		 515 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  31.99 
 
 		 515 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  32.03 
 
 		 517 aa  177  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  32.03 
 
 		 517 aa  177  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  32.03 
 
 		 517 aa  177  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  32.03 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  32.03 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  32.03 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  32.03 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  32.03 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  32.03 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  32.03 
 
 		 517 aa  176  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  31.84 
 
 		 517 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  32.06 
 
 		 515 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  31.8 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  31.36 
 
 		 508 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  31.17 
 
 		 508 aa  160  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  31.17 
 
 		 508 aa  160  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  31.17 
 
 		 508 aa  160  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  31.17 
 
 		 508 aa  160  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  31.17 
 
 		 508 aa  160  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  30.46 
 
 		 453 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1876  putative transposase  35.96 
 
 		 305 aa  114  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  29.81 
 
 		 553 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  35.42 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  25.29 
 
 		 566 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  25.29 
 
 		 566 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  25.29 
 
 		 566 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  26.13 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  26.13 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  26.13 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  26.13 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  23.64 
 
 		 559 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  23.64 
 
 		 594 aa  93.2  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  23.64 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  26.13 
 
 		 585 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  26.33 
 
 		 559 aa  84.7  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  22.24 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  22.24 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  22.24 
 
 		 551 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  25.71 
 
 		 554 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1656  transposase IS4 family protein  21.94 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.129974  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  34.23 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  21.56 
 
 		 513 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  24.01 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  25.49 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  28.47 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  24.81 
 
 		 559 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2138  transposase for IS660  27.23 
 
 		 271 aa  55.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.677617  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3694  transposase for IS660  27.23 
 
 		 271 aa  55.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  24.41 
 
 		 547 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1178  hypothetical protein  21.26 
 
 		 512 aa  54.3  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.216502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  22.17 
 
 		 406 aa  54.3  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1172  hypothetical protein  21.26 
 
 		 462 aa  53.9  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0849908 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2817  transposase  25.91 
 
 		 649 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000632449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  24.41 
 
 		 557 aa  53.9  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0960  hypothetical protein  21.26 
 
 		 461 aa  53.5  0.000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2953  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.67663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0203  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0217  ISBma2, transposase  26.54 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2096  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 522 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3562  transposase  25.29 
 
 		 493 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1749  transposase  25.29 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0782  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 493 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0251  ISBma2, transposase  26.54 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  25.29 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2662  transposase  25.29 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.942406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0130  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 541 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2538  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2294  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104034  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2033  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 497 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0026  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.462908  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2843  transposase  25.29 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2829  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 533 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1521  ISBma2, transposase  25.29 
 
 		 524 aa  52.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>