259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1873 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  100 
 
 		 213 aa  436  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  83.91 
 
 		 454 aa  306  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 518 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 518 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  34.23 
 
 		 576 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  31.31 
 
 		 502 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  34.01 
 
 		 453 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 553 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 553 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 553 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 553 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 553 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  31.05 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  31.05 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  31.05 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  31.05 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  31.05 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  31.05 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  31.05 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  31.05 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  30.27 
 
 		 585 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  30.27 
 
 		 585 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  30.27 
 
 		 585 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  30.27 
 
 		 585 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  30.27 
 
 		 585 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  30.53 
 
 		 517 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  30.53 
 
 		 517 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  30.13 
 
 		 680 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  34.51 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  34.51 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  34.51 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  34.51 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  30.53 
 
 		 517 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  34.51 
 
 		 515 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  29.2 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  29.89 
 
 		 558 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  30.88 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  30.88 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  30.88 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  28.04 
 
 		 551 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 508 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  26.89 
 
 		 566 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  26.89 
 
 		 566 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 508 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 508 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  28.04 
 
 		 569 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 508 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  26.89 
 
 		 566 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 508 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  28.5 
 
 		 508 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 508 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  28.04 
 
 		 551 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  31.15 
 
 		 483 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1292  transposase, IS4  32.03 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.440314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  31.75 
 
 		 515 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  26.67 
 
 		 559 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0082  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0381  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.653097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0388  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0426  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0488  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0728  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0457803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1500  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1503  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.596952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1715  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1718  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1742  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0432719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2227  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2340  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2362  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2418  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.692381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2563  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2753  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2790  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0388897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2803  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2912  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.199238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2982  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3139  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0516599  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3182  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1994  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 509 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.552518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3239  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3291  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0170  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0332  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0872  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0307509  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0878  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1506  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1804  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1968  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2075  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2116  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0595075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2953  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.67663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3337  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0123  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 487 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00838697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2294  ISBma2, transposase  29.93 
 
 		 509 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.104034  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2817  transposase  29.93 
 
 		 649 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000632449  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 559 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3521  transposase  29.93 
 
 		 482 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>