More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2993 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  100 
 
 
553 aa  1105    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  100 
 
 
553 aa  1105    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  100 
 
 
553 aa  1105    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  100 
 
 
553 aa  1105    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  100 
 
 
553 aa  1105    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  69.29 
 
 
559 aa  686    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  85.45 
 
 
352 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  45.86 
 
 
551 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  45.86 
 
 
569 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  45.86 
 
 
551 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  45.59 
 
 
566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  45.59 
 
 
566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  45.59 
 
 
566 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  42.45 
 
 
559 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  42.45 
 
 
594 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  46.52 
 
 
559 aa  438  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  45.77 
 
 
554 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  42.56 
 
 
522 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  45.88 
 
 
558 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  45.88 
 
 
558 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  40.54 
 
 
511 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  46.47 
 
 
490 aa  362  8e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  40.65 
 
 
585 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  40.65 
 
 
585 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  40.65 
 
 
585 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  40.65 
 
 
585 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  40.65 
 
 
585 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  46.1 
 
 
483 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  43.18 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  50.53 
 
 
442 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  40.77 
 
 
424 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  43.39 
 
 
406 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  38.99 
 
 
680 aa  310  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  46.47 
 
 
272 aa  217  5.9999999999999996e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  42.75 
 
 
360 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  38.81 
 
 
223 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1874  hypothetical protein  39.09 
 
 
229 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1900  transposase  86.11 
 
 
72 aa  127  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3240  hypothetical protein  70.13 
 
 
106 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  29.2 
 
 
575 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
517 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
517 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
517 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
517 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
517 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
517 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
517 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
517 aa  98.2  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  54.76 
 
 
83 aa  97.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  29.81 
 
 
576 aa  98.2  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  54.65 
 
 
97 aa  96.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 
517 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  27.74 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  27.74 
 
 
517 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  27.72 
 
 
515 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  27.72 
 
 
515 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  27.72 
 
 
515 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  30.33 
 
 
508 aa  92  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  27.29 
 
 
515 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  29.01 
 
 
508 aa  90.9  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  54.55 
 
 
106 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  27.29 
 
 
515 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  27.29 
 
 
515 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  27.29 
 
 
515 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  27.29 
 
 
515 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  53.41 
 
 
106 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  52.87 
 
 
106 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  36.48 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  36.48 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  36.48 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  36.48 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  36.48 
 
 
508 aa  81.6  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  26.99 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  48.51 
 
 
140 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  23.28 
 
 
518 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  23.28 
 
 
518 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  20.78 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  26.86 
 
 
515 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  22.54 
 
 
548 aa  63.9  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  22.54 
 
 
548 aa  63.9  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  22.54 
 
 
548 aa  63.9  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  22.54 
 
 
548 aa  63.9  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  22.54 
 
 
548 aa  63.9  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  22.54 
 
 
515 aa  63.9  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  30.14 
 
 
213 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  29.07 
 
 
458 aa  60.1  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
450 aa  58.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
450 aa  58.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>