More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2276 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  70 
 
 
460 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  70 
 
 
460 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  100 
 
 
450 aa  929    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  67.83 
 
 
457 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  67.83 
 
 
457 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  70 
 
 
460 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  67.83 
 
 
457 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  67.83 
 
 
457 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  72.89 
 
 
458 aa  667    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  100 
 
 
450 aa  929    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  100 
 
 
450 aa  929    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  70 
 
 
460 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  70 
 
 
460 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  70 
 
 
460 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  70 
 
 
460 aa  659    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  67.11 
 
 
458 aa  620  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  67.11 
 
 
458 aa  620  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  67.11 
 
 
460 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4079  transposase IS4 family protein  60.75 
 
 
460 aa  535  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0888192 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3682  transposase IS4 family protein  60.75 
 
 
460 aa  535  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399219  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3878  transposase IS4 family protein  60.75 
 
 
460 aa  535  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.726843 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3231  ISPsy22, transposase truncated  62.45 
 
 
248 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0818  transposase and inactivated derivative  73.2 
 
 
224 aa  299  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149498  hitchhiker  0.00134243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3060  hypothetical protein  59.11 
 
 
298 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979021  normal  0.0493517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  29.96 
 
 
557 aa  212  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  30.22 
 
 
547 aa  210  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 
557 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1293  transposase  62.18 
 
 
244 aa  203  6e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164367  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1376  ISBma2, transposase  32.42 
 
 
505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1172  hypothetical protein  30.47 
 
 
462 aa  196  9e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0849908 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1178  hypothetical protein  30.7 
 
 
512 aa  196  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.216502 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1722  ISBma2, transposase  32.22 
 
 
580 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0960  hypothetical protein  30.47 
 
 
461 aa  196  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3337  ISBma2, transposase  33.18 
 
 
487 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0168  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2740  ISBma2, transposase  33.18 
 
 
487 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2953  ISBma2, transposase  33.18 
 
 
487 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.67663  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2662  transposase  33.18 
 
 
493 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.942406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1749  transposase  33.18 
 
 
493 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1727  transposase  33.18 
 
 
493 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0108  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  193  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.745289  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2843  transposase  33.18 
 
 
493 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2538  ISBma2, transposase  33.18 
 
 
493 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0176  transposase  33.18 
 
 
493 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188761  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3216  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.450921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0217  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0251  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
514 aa  192  8e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3521  transposase  32.96 
 
 
482 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1196  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
503 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780467  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1556  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
513 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1114  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
510 aa  192  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1050  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000211286  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3102  transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0143  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0132303  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1381  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1275  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3324  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1093  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1702  transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1424  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0315301  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0896  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
523 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2975  transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3200  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
514 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0017  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
497 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1737  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1522  transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0988  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171105  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0191  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1102  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0681  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
541 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1508  transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.948339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2224  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2087  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0444766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2252  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0051  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0082  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0381  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.653097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0388  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0426  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0488  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0728  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0457803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1265  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1500  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1503  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.596952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1585  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1715  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1718  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1739  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1742  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0432719  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0878  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1121  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1506  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1804  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1968  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2075  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2116  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0595075  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1017  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
487 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2098  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
497 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2287  ISBma2, transposase  32.96 
 
 
515 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>