25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3240 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3240  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  70.13 
 
 
553 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  70.13 
 
 
553 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  70.13 
 
 
553 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  70.13 
 
 
553 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  70.13 
 
 
553 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1900  transposase  75 
 
 
72 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  58.33 
 
 
559 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  66.67 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  55.36 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  50 
 
 
569 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  50.88 
 
 
551 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  50.88 
 
 
551 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  49.23 
 
 
511 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  49.06 
 
 
106 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  48.08 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  50 
 
 
442 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  47.06 
 
 
559 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  47.92 
 
 
554 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  47.92 
 
 
106 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  35.71 
 
 
594 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  35.71 
 
 
559 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  38.78 
 
 
566 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  38.78 
 
 
566 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  38.78 
 
 
566 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>