91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8647 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  688    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  85.45 
 
 
553 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  85.45 
 
 
553 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  85.45 
 
 
553 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  85.45 
 
 
553 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  85.45 
 
 
553 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  69.44 
 
 
559 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  46.75 
 
 
569 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  46.75 
 
 
551 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  46.75 
 
 
551 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  48.24 
 
 
566 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  48.24 
 
 
566 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  48.24 
 
 
566 aa  256  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  47.77 
 
 
559 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  50.32 
 
 
442 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  44.38 
 
 
559 aa  252  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  44.38 
 
 
594 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  49.04 
 
 
558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  49.04 
 
 
558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  47.91 
 
 
554 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  42.59 
 
 
511 aa  238  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  44.48 
 
 
522 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  44.63 
 
 
406 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 
585 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 
585 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 
585 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 
585 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 
585 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  48.94 
 
 
490 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  44.78 
 
 
272 aa  196  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  41.18 
 
 
680 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  47.66 
 
 
483 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  45.23 
 
 
502 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  41.06 
 
 
360 aa  159  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  43.35 
 
 
424 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1900  transposase  87.5 
 
 
72 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3240  hypothetical protein  66.67 
 
 
106 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  55.95 
 
 
83 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  56.82 
 
 
106 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  55.68 
 
 
106 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  52.87 
 
 
97 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  55.17 
 
 
106 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  45.1 
 
 
140 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
508 aa  68.9  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  38.52 
 
 
508 aa  67.4  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  29.27 
 
 
575 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  57  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 
517 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  33.56 
 
 
453 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  30.38 
 
 
515 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  30.38 
 
 
515 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  30.38 
 
 
515 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  30.38 
 
 
515 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  30.38 
 
 
515 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  30.38 
 
 
515 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  30.38 
 
 
515 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  30.38 
 
 
515 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  30.38 
 
 
515 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  23.39 
 
 
515 aa  44.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  23.39 
 
 
548 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  23.39 
 
 
548 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  23.39 
 
 
548 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  23.39 
 
 
548 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  23.39 
 
 
548 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1876  putative transposase  29.89 
 
 
305 aa  43.1  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.552399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>