More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3837 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 558 aa  1137    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 558 aa  1137    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  47.47 
 
 		 559 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  47.47 
 
 		 594 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  46.29 
 
 		 551 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  46.29 
 
 		 551 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  46.29 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  57.95 
 
 		 502 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  47.43 
 
 		 522 aa  493  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  49.53 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  49.53 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  49.53 
 
 		 566 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  48.71 
 
 		 559 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  48.43 
 
 		 554 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  43.78 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  43.78 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  43.78 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  43.78 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  43.78 
 
 		 585 aa  434  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  48.65 
 
 		 680 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  45.88 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  45.88 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  45.88 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  45.88 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  45.88 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  46.71 
 
 		 559 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  48.78 
 
 		 406 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  44.73 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  40.19 
 
 		 511 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  45.91 
 
 		 490 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  44.59 
 
 		 483 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  49.48 
 
 		 442 aa  340  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  52.24 
 
 		 272 aa  276  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  48.84 
 
 		 352 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  52.65 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1874  hypothetical protein  50 
 
 		 229 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  41.28 
 
 		 223 aa  183  7e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7064  hypothetical protein  73.23 
 
 		 97 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.124079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  66 
 
 		 140 aa  124  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  25.34 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  25.34 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  59.79 
 
 		 97 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  27.39 
 
 		 508 aa  109  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  28.51 
 
 		 515 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  26.75 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  50.52 
 
 		 106 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  50.52 
 
 		 106 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  27.29 
 
 		 453 aa  87.8  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  48.45 
 
 		 106 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  46.99 
 
 		 83 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  22.61 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  22.61 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  22.61 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  22.61 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  22.61 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  22.61 
 
 		 548 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  25.12 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  28.78 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  22.91 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  24.76 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  28.42 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  28.42 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  29.8 
 
 		 213 aa  62.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  32.58 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  33.87 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  28.73 
 
 		 515 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2287  ISBma2, transposase  25.82 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3029  ISBma2, transposase  25.82 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  26.18 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>