More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1323 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 508 aa  1028    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  99.8 
 
 		 508 aa  1026    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 508 aa  1028    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 508 aa  1028    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 508 aa  1028    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  94.69 
 
 		 508 aa  972    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  99.8 
 
 		 508 aa  1026    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  47.1 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  47.01 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  47.1 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  47.1 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  47.1 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  47.3 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  47.3 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  47.3 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  47.3 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  46.14 
 
 		 517 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  46.14 
 
 		 517 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  46.14 
 
 		 517 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  44.44 
 
 		 453 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  30.27 
 
 		 518 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  30.27 
 
 		 518 aa  189  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  31.17 
 
 		 576 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  27.5 
 
 		 566 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  27.5 
 
 		 566 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  27.5 
 
 		 566 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  27.39 
 
 		 558 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  27.39 
 
 		 558 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  24.53 
 
 		 594 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  24.53 
 
 		 559 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  24.74 
 
 		 513 aa  97.4  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  24.56 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 		 559 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 569 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 551 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 551 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  30.18 
 
 		 680 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  28.4 
 
 		 511 aa  86.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  39.1 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  39.1 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  39.1 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  39.1 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  39.1 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  38.14 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  38.14 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  25.69 
 
 		 554 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1656  transposase IS4 family protein  22.38 
 
 		 486 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.129974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  36.99 
 
 		 559 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  22.16 
 
 		 515 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  22.16 
 
 		 548 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  22.16 
 
 		 548 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  22.16 
 
 		 548 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  22.16 
 
 		 548 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  22.16 
 
 		 548 aa  75.9  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  41.67 
 
 		 97 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  38.52 
 
 		 352 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  24.18 
 
 		 575 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  31.21 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  34.33 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  23.13 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  23.13 
 
 		 557 aa  60.1  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  33.77 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0420  hypothetical protein  31.78 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  24.56 
 
 		 557 aa  56.6  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2772  ISGsu3, transposase  30.23 
 
 		 362 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  28.39 
 
 		 454 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  28.3 
 
 		 213 aa  54.7  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5975  IS4 family transposase  37.66 
 
 		 366 aa  53.9  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00514  putative ISXoo14 transposase  30.97 
 
 		 333 aa  53.9  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  24.72 
 
 		 502 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0419  transposase, IS4 family protein  40 
 
 		 364 aa  52.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4041  transposase, IS4  34.86 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923218  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4149  transposase, IS4  34.86 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4261  transposase, IS4  34.86 
 
 		 349 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0257321  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02785  putative ISXoo14 transposase  33.33 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3230  transposase IS4 family protein  41.27 
 
 		 367 aa  52  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>