More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7033 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  69.29 
 
 
553 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  69.29 
 
 
553 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  100 
 
 
559 aa  1112    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  69.29 
 
 
553 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  69.29 
 
 
553 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  69.29 
 
 
553 aa  712    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  44.42 
 
 
569 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  44.42 
 
 
551 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  44.42 
 
 
551 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  47 
 
 
559 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  47.95 
 
 
554 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  42.32 
 
 
559 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  42.32 
 
 
594 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  43.8 
 
 
566 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  43.8 
 
 
566 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  43.8 
 
 
566 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 
558 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  47.34 
 
 
558 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  42.37 
 
 
522 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  65.19 
 
 
352 aa  405  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  41.23 
 
 
511 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  45.13 
 
 
490 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  51.03 
 
 
442 aa  339  8e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  38.74 
 
 
585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  38.74 
 
 
585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  38.74 
 
 
585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  38.74 
 
 
585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  38.74 
 
 
585 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  43.04 
 
 
502 aa  333  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  45.3 
 
 
483 aa  329  9e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  42.86 
 
 
406 aa  317  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  40 
 
 
424 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  39.75 
 
 
680 aa  300  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  45.45 
 
 
272 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  41.52 
 
 
360 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  39.09 
 
 
223 aa  163  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1874  hypothetical protein  40.36 
 
 
229 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1900  transposase  79.17 
 
 
72 aa  113  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  27.46 
 
 
515 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  27.46 
 
 
515 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  27.46 
 
 
515 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  27.46 
 
 
515 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  27.46 
 
 
515 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  55.67 
 
 
97 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  28.08 
 
 
517 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  27.89 
 
 
517 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  27.89 
 
 
517 aa  107  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  29.69 
 
 
508 aa  105  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  27.7 
 
 
517 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  27.7 
 
 
517 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  27.7 
 
 
517 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  27.7 
 
 
517 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  27.7 
 
 
517 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  59.04 
 
 
83 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  27.7 
 
 
517 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  27.7 
 
 
517 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  27.7 
 
 
517 aa  104  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  56.67 
 
 
106 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3240  hypothetical protein  58.33 
 
 
106 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  55.56 
 
 
106 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 
515 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 
515 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  27.49 
 
 
515 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  54.44 
 
 
106 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  27.18 
 
 
575 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 
508 aa  76.6  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  45.45 
 
 
140 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 
508 aa  76.6  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 
508 aa  76.6  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  27.48 
 
 
515 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 
508 aa  76.6  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 
508 aa  76.6  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 
508 aa  76.6  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  21.46 
 
 
548 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  21.46 
 
 
548 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  21.46 
 
 
548 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  21.46 
 
 
515 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  21.46 
 
 
548 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  21.46 
 
 
548 aa  66.2  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  25.79 
 
 
576 aa  62  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2817  transposase  26.06 
 
 
649 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000632449  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4723  transposase  47.54 
 
 
64 aa  57  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  30.07 
 
 
453 aa  56.6  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3562  transposase  25.8 
 
 
493 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6467  transposase IS4 family protein  35.66 
 
 
472 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1265  ISBma2, transposase  25.8 
 
 
487 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1585  ISBma2, transposase  25.8 
 
 
487 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  26.15 
 
 
493 aa  56.2  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>