152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3834 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  87.76 
 
 		 554 aa  647    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  884    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  87.41 
 
 		 490 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  87.12 
 
 		 483 aa  487  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  46.13 
 
 		 569 aa  359  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  46.13 
 
 		 551 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  46.13 
 
 		 551 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  50.8 
 
 		 566 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  50.8 
 
 		 566 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  50.8 
 
 		 566 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  51.03 
 
 		 559 aa  342  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  46.49 
 
 		 559 aa  339  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  46.49 
 
 		 594 aa  339  7e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  50.53 
 
 		 553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  50.53 
 
 		 553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  50.53 
 
 		 553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  50.53 
 
 		 553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  50.53 
 
 		 553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  49.32 
 
 		 559 aa  329  6e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  49.48 
 
 		 558 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  49.48 
 
 		 558 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  45.27 
 
 		 511 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  46.63 
 
 		 406 aa  315  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  46.63 
 
 		 522 aa  315  8e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  43.75 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  43.75 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  43.75 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  43.75 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  43.75 
 
 		 585 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  47.92 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  48.47 
 
 		 502 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  41.21 
 
 		 680 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  48.11 
 
 		 272 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  46 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  42.91 
 
 		 360 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  90 
 
 		 106 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  88.89 
 
 		 106 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  88.89 
 
 		 106 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  51.55 
 
 		 97 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  53.42 
 
 		 83 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  46.46 
 
 		 140 aa  73.9  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  25.71 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  30.14 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  76.6 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  33.77 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  33.77 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  33.77 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  33.77 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  33.77 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  33.77 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  34.29 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  27.27 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1900  transposase  56.67 
 
 		 72 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  80.56 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  27.27 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  27.27 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  27.27 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  27.27 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  77.78 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  77.78 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  77.78 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  77.78 
 
 		 289 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  32.82 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  32.82 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  32.82 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  32.82 
 
 		 515 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  35.24 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1803  putative transposase  33.93 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.764037 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6134  transposase IS4 family protein  35.23 
 
 		 368 aa  57  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.647313  normal  0.885579 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4959  transposase IS4 family protein  35.23 
 
 		 368 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.428493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1876  putative transposase  33.33 
 
 		 305 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00514  putative ISXoo14 transposase  34.55 
 
 		 333 aa  53.9  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6786  transposase IS4 family protein  32.95 
 
 		 368 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  29.31 
 
 		 518 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  29.31 
 
 		 518 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02785  putative ISXoo14 transposase  31.9 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00235  putative ISXoo14 transposase  31.9 
 
 		 365 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4641  transposase, IS4  30.33 
 
 		 222 aa  51.6  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.395706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>