81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0233 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  100 
 
 
594 aa  205  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  100 
 
 
559 aa  204  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  100 
 
 
522 aa  202  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  100 
 
 
406 aa  202  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  200  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  100 
 
 
97 aa  199  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  59.79 
 
 
558 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  59.79 
 
 
558 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  56.7 
 
 
551 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  56.7 
 
 
551 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  56.7 
 
 
569 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  55.67 
 
 
559 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  53.12 
 
 
511 aa  107  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  55.67 
 
 
559 aa  106  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  56.25 
 
 
585 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  56.25 
 
 
585 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  56.25 
 
 
585 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  56.25 
 
 
585 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  56.25 
 
 
585 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  51.58 
 
 
680 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  54.02 
 
 
566 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  54.02 
 
 
566 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  54.02 
 
 
566 aa  99.8  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  51.55 
 
 
442 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  51.55 
 
 
554 aa  97.1  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  54.65 
 
 
553 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  54.65 
 
 
553 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  54.65 
 
 
553 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  54.65 
 
 
553 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  54.65 
 
 
553 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  47.42 
 
 
360 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  52.87 
 
 
352 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
508 aa  73.6  0.0000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
508 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
508 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
508 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
508 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
508 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  41.67 
 
 
508 aa  73.2  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  45.07 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  52.73 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  48.39 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  48.39 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  48.39 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  32.58 
 
 
453 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  29.89 
 
 
515 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  29.89 
 
 
515 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  29.89 
 
 
515 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  29.89 
 
 
515 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  29.89 
 
 
515 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  62.86 
 
 
502 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  28.74 
 
 
515 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  28.74 
 
 
515 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  28.74 
 
 
515 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  28.74 
 
 
515 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  58.33 
 
 
490 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  32.14 
 
 
454 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  29.87 
 
 
517 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  32.18 
 
 
576 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>