280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5051 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  100 
 
 
559 aa  1128    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  43.59 
 
 
551 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  43.59 
 
 
569 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  43.59 
 
 
551 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  45.25 
 
 
566 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  45.25 
 
 
566 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  45.25 
 
 
566 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  48.71 
 
 
558 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  48.71 
 
 
558 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  41.92 
 
 
559 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  41.35 
 
 
594 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  46.52 
 
 
553 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  46.52 
 
 
553 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  46.52 
 
 
553 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  46.52 
 
 
553 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  46.52 
 
 
553 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  42.03 
 
 
522 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  45.76 
 
 
559 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  43.56 
 
 
554 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  47.4 
 
 
502 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
585 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
585 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
585 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
585 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  41.36 
 
 
585 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  43.91 
 
 
490 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  43.67 
 
 
483 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  37.19 
 
 
511 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  49.45 
 
 
442 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  41.19 
 
 
406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  39.73 
 
 
680 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  39.33 
 
 
424 aa  306  7e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  48.55 
 
 
352 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  46.15 
 
 
272 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  46.67 
 
 
360 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  38.07 
 
 
223 aa  158  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1874  hypothetical protein  43.9 
 
 
229 aa  157  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0233  transposase  55.67 
 
 
97 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  30.09 
 
 
517 aa  102  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  30.09 
 
 
517 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  24 
 
 
518 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  24 
 
 
518 aa  101  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  30.09 
 
 
517 aa  101  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  29.59 
 
 
517 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  29.59 
 
 
517 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  29.59 
 
 
517 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  29.59 
 
 
517 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  29.59 
 
 
517 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3053  hypothetical protein  56.99 
 
 
140 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  29.59 
 
 
517 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  29.59 
 
 
517 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4015  hypothetical protein  60 
 
 
106 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  29.59 
 
 
517 aa  99.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2511  hypothetical protein  60 
 
 
106 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.933642  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  29.03 
 
 
508 aa  96.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  27.86 
 
 
508 aa  95.5  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
508 aa  95.1  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
508 aa  95.1  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
508 aa  95.1  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  28.83 
 
 
508 aa  95.1  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  28.54 
 
 
515 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  28.54 
 
 
515 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  28.54 
 
 
515 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  28.54 
 
 
515 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5546  hypothetical protein  59.49 
 
 
106 aa  94  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  28.35 
 
 
515 aa  93.6  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0129  transposase  51.81 
 
 
83 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  25.42 
 
 
575 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  26.33 
 
 
576 aa  77  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  37.84 
 
 
508 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1900  transposase  52.38 
 
 
72 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7064  hypothetical protein  38.33 
 
 
97 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.124079  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2451  hypothetical protein  19.54 
 
 
513 aa  62  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  38.05 
 
 
453 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2204  transposase, IS4 family protein  36.04 
 
 
515 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627915  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2093  transposase, IS4 family protein  36.04 
 
 
515 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.138007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1199  transposase, IS4 family protein  36.04 
 
 
515 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0728  transposase, IS4 family protein  35.14 
 
 
515 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336373  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0534  transposase, IS4 family protein  25.7 
 
 
411 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0138  hypothetical protein  22.63 
 
 
406 aa  52  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4723  transposase  49.12 
 
 
64 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  27.07 
 
 
458 aa  50.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3240  hypothetical protein  47.06 
 
 
106 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  26.67 
 
 
213 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  27.59 
 
 
454 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  26.84 
 
 
493 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1433  transposase, IS4 family protein  30.77 
 
 
405 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2221  ISBma2, transposase  25.97 
 
 
545 aa  45.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0858629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>