36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7064 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7064  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  196  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.124079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  73.23 
 
 		 558 aa  173  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  73.23 
 
 		 558 aa  173  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1874  hypothetical protein  37.7 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  38.33 
 
 		 559 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3903  transposase  39.66 
 
 		 502 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  35.85 
 
 		 566 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  35.85 
 
 		 566 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  35.85 
 
 		 566 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  26.67 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  26.67 
 
 		 559 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  26.67 
 
 		 594 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  26.67 
 
 		 522 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  26.67 
 
 		 424 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  29.84 
 
 		 554 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 		 569 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 		 551 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 		 551 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  31.58 
 
 		 585 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  31.58 
 
 		 585 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  31.58 
 
 		 585 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  31.58 
 
 		 585 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  31.58 
 
 		 585 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  34.62 
 
 		 680 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>