More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3903 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3903  transposase  100 
 
 		 502 aa  1013    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3535  transposase IS4 family protein  57.95 
 
 		 558 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3837  transposase IS4 family protein  57.95 
 
 		 558 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1724  hypothetical protein  50.11 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00874348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2054  hypothetical protein  50.11 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0120012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1452  hypothetical protein  50.11 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0363  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0539  transposase IS4  47.07 
 
 		 559 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0995  transposase IS4  47.07 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000801512  normal  0.101029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0997  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0332935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1604  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1887  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1935  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000942211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2634  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.798145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3055  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3416  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3675  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3789  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.461273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4021  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.521805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4743  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4770  transposase IS4  47.07 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4558  transposase IS4 family protein  44.18 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4585  transposase IS4 family protein  44.18 
 
 		 551 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.34521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4088  transposase IS4 family protein  44.18 
 
 		 551 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.482061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5051  transposase IS4 family protein  47.3 
 
 		 559 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0234  transposase IS4  45.88 
 
 		 424 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5548  hypothetical protein  45.57 
 
 		 490 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3699  hypothetical protein  47.75 
 
 		 680 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4013  transposase IS4 family protein  45.93 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0852  hypothetical protein  44.62 
 
 		 554 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8418  transposase IS4 family protein  42.8 
 
 		 553 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2993  transposase IS4 family protein  42.8 
 
 		 553 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8094  transposase IS4 family protein  42.8 
 
 		 553 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6442  transposase IS4 family protein  42.8 
 
 		 553 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.40151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3849  transposase IS4 family protein  42.8 
 
 		 553 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464426  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4567  transposase  49.85 
 
 		 406 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7033  transposase IS4 family protein  41.77 
 
 		 559 aa  326  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5764  transposase IS4 family protein  39.83 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00437315  normal  0.29021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3517  transposase IS4 family protein  39.83 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3521  transposase IS4 family protein  39.83 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9207  transposase IS4 family protein  39.83 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.63924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4721  transposase IS4 family protein  39.83 
 
 		 585 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5032  hypothetical protein  36.28 
 
 		 511 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0989917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  46.18 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2968  hypothetical protein  54.5 
 
 		 272 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1874  hypothetical protein  43.67 
 
 		 229 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.360142 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8647  hypothetical protein  45.65 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.99895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2969  transposase  40.37 
 
 		 223 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1875  transposase  53.57 
 
 		 360 aa  143  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.590508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7064  hypothetical protein  39.66 
 
 		 97 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.124079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1442  transposase IS4 family protein  25.59 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2017  transposase IS4 family protein  25.59 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.167973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0101  hypothetical protein  37.12 
 
 		 454 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.39004 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1873  transposase, IS4  31.31 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4420  hypothetical protein  26.79 
 
 		 575 aa  63.5  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187576  normal  0.765326 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  25.15 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  25.15 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5515  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0553  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0747  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190657  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2074  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4071  transposase, IS4 family protein  31.22 
 
 		 515 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2448  transposase IS4 family protein  28.71 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00936431  normal  0.0152831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0111  transposase IS4 family protein  28.71 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3900  transposase IS4 family protein  28.71 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0647808  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4333  transposase IS4 family protein  28.71 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1610  transposase IS4 family protein  28.71 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.60158  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2032  transposase IS4 family protein  24.6 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.214067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2881  transposase IS4 family protein  28.71 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169623  hitchhiker  0.00149242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4748  transposase IS4 family protein  28.71 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.655598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1980  transposase IS4 family protein  28.71 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000458389  normal  0.037221 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2286  IS4 family transposase  25.49 
 
 		 576 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1222  transposase IS4 family protein  28.52 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1386  transposase IS4 family protein  28.52 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00661518  hitchhiker  0.00725427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  27.17 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4851  transposase IS4 family protein  28.52 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.769093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  27.17 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  27.17 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0718  hypothetical protein  21.97 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0290  hypothetical protein  21.97 
 
 		 548 aa  57  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0216247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0310  hypothetical protein  21.97 
 
 		 548 aa  57  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0514  hypothetical protein  21.97 
 
 		 548 aa  57  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1592  hypothetical protein  21.97 
 
 		 548 aa  57  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1757  hypothetical protein  21.97 
 
 		 548 aa  57  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  23.94 
 
 		 458 aa  57  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  26.98 
 
 		 460 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  23.85 
 
 		 275 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1487  transposase IS4 family protein  24.55 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.0024926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1323  transposase IS4 family protein  24.55 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.555247  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1842  transposase IS4 family protein  24.55 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1387  transposase IS4 family protein  24.55 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.311179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1477  transposase IS4 family protein  24.55 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1399  transposase IS4 family protein  24.55 
 
 		 508 aa  53.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.943473  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  25.94 
 
 		 351 aa  53.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  26.15 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  26.15 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  26.15 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1012  transposase  32.16 
 
 		 504 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.662877  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  26.15 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4651  hypothetical protein  25.52 
 
 		 453 aa  52.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>