More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0758 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  100 
 
 
275 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  71.27 
 
 
351 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  68.36 
 
 
481 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  67.64 
 
 
481 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  68.36 
 
 
481 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  66.42 
 
 
482 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  68.36 
 
 
481 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  64.86 
 
 
482 aa  388  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  63.98 
 
 
497 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  63.98 
 
 
497 aa  354  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  60.15 
 
 
478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  57.14 
 
 
493 aa  325  6e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  56.78 
 
 
493 aa  324  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  55.72 
 
 
478 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  55.35 
 
 
478 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  50 
 
 
479 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  50 
 
 
479 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  54.04 
 
 
249 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  47.69 
 
 
477 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  44.85 
 
 
499 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  40.86 
 
 
486 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  40.78 
 
 
472 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  38.24 
 
 
472 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  38.24 
 
 
472 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  51.83 
 
 
390 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  88.89 
 
 
334 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0914  hypothetical protein  55.75 
 
 
124 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770836  normal  0.101303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  33.47 
 
 
473 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0594  transposase, IS4  59.74 
 
 
78 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  29.7 
 
 
457 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  29.7 
 
 
457 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  29.7 
 
 
457 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  29.7 
 
 
457 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2405  hypothetical protein  58.57 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1524  transposase  31.5 
 
 
493 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1727  transposase  31.5 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2662  transposase  31.5 
 
 
493 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.942406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2843  transposase  31.5 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2740  ISBma2, transposase  31.5 
 
 
487 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2953  ISBma2, transposase  31.5 
 
 
487 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.67663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3337  ISBma2, transposase  31.5 
 
 
487 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  31.5 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1749  transposase  31.5 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2817  transposase  31.5 
 
 
649 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000632449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3562  transposase  31.5 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0176  transposase  31.5 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2538  ISBma2, transposase  31.5 
 
 
493 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  31.5 
 
 
493 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0945  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
516 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.867546  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2033  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1722  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
580 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2951  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
550 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0779698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2581  putative transposase  31.1 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2189  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
518 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0757  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
577 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2518  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
539 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2522  transposase  31.1 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.981989  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0203  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
516 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0917  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304514  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1342  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
538 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0197  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
538 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0017  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
497 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0676  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0728  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0457803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1500  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1503  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.596952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3200  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1715  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1718  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1739  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3291  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3361  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0170  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0332  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0872  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0307509  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0878  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1121  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1506  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1804  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1968  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2075  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2116  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
487 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0595075  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2779  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
537 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3324  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2224  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2248  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2227  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2002  ISBma2, transposase  31.1 
 
 
607 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>