95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0914 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0914  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770836  normal  0.101303 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  98.39 
 
 		 249 aa  255  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  57.5 
 
 		 481 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  57.5 
 
 		 481 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  55.74 
 
 		 478 aa  150  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  55 
 
 		 481 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  55 
 
 		 481 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  54.92 
 
 		 493 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  54.1 
 
 		 493 aa  147  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  57.5 
 
 		 351 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  55.93 
 
 		 482 aa  145  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  54.1 
 
 		 478 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  53.28 
 
 		 478 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  53.33 
 
 		 497 aa  141  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  53.33 
 
 		 497 aa  141  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  52.5 
 
 		 482 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  55.75 
 
 		 275 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  61.39 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  61.39 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  50.85 
 
 		 477 aa  123  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  44.55 
 
 		 472 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0594  transposase, IS4  60.53 
 
 		 78 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  46.53 
 
 		 499 aa  94.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  43.4 
 
 		 473 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  39.64 
 
 		 472 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  39.64 
 
 		 472 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  40.91 
 
 		 486 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  40 
 
 		 509 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6467  transposase IS4 family protein  33.04 
 
 		 472 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2197  transposase IS4 family protein  35.34 
 
 		 482 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.263222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2162  transposase IS4 family protein  35.34 
 
 		 482 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0229344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1113  transposase IS4 family protein  35.34 
 
 		 482 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2730  transposase IS1182 family protein  46.27 
 
 		 447 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.271694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3052  transposase IS1182 family protein  46.27 
 
 		 447 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000434143  normal  0.286719 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2711  transposase IS1182 family protein  46.27 
 
 		 447 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0171  transposase IS1182 family protein  46.27 
 
 		 447 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1665  transposase IS1182 family protein  46.27 
 
 		 447 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1782  transposase IS1182 family protein  46.27 
 
 		 447 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1840  transposase IS1182 family protein  46.27 
 
 		 447 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2657  transposase IS1182 family protein  46.27 
 
 		 447 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817106  normal  0.241494 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  28.69 
 
 		 547 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1571  transposase IS4 family protein  46.15 
 
 		 513 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0160489  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1874  transposase IS4 family protein  24.56 
 
 		 227 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1154  transposase IS4 family protein  34.62 
 
 		 486 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.543034  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  50 
 
 		 455 aa  47.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0574  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 455 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0786  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 455 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.980261  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0227  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 455 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2464  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 455 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1576  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 455 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0562343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 557 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2261  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 455 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2272  transposase IS4 family protein  40 
 
 		 455 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 557 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  46 
 
 		 452 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  31.25 
 
 		 457 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  31.25 
 
 		 457 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  31.25 
 
 		 457 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  31.25 
 
 		 457 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  35.24 
 
 		 460 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>