72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0594 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0594  transposase, IS4  100 
 
 
78 aa  161  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  80.77 
 
 
479 aa  133  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  80.77 
 
 
479 aa  133  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  71.79 
 
 
493 aa  122  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  70.51 
 
 
493 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  65.38 
 
 
478 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  67.53 
 
 
351 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  64.47 
 
 
478 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  66.23 
 
 
481 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  66.23 
 
 
481 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  66.23 
 
 
482 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  65.38 
 
 
478 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  64.47 
 
 
497 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  64.47 
 
 
497 aa  104  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  62.34 
 
 
477 aa  103  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  61.04 
 
 
481 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  61.04 
 
 
481 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  58.44 
 
 
482 aa  98.6  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0914  hypothetical protein  60.53 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770836  normal  0.101303 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  60 
 
 
249 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  59.74 
 
 
275 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  51.28 
 
 
499 aa  82.8  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  49.32 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  45.95 
 
 
472 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  45.95 
 
 
472 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  46.58 
 
 
472 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  43.24 
 
 
473 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1782  transposase IS1182 family protein  44.44 
 
 
447 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0171  transposase IS1182 family protein  44.44 
 
 
447 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1665  transposase IS1182 family protein  44.44 
 
 
447 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1840  transposase IS1182 family protein  44.44 
 
 
447 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2657  transposase IS1182 family protein  44.44 
 
 
447 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.817106  normal  0.241494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2711  transposase IS1182 family protein  44.44 
 
 
447 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205202  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2730  transposase IS1182 family protein  44.44 
 
 
447 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.271694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3052  transposase IS1182 family protein  44.44 
 
 
447 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000434143  normal  0.286719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  48.89 
 
 
452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  47.62 
 
 
455 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>