More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3317 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  96.86 
 
 		 478 aa  976    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 478 aa  1002    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  62.47 
 
 		 481 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  62.47 
 
 		 481 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  66.67 
 
 		 493 aa  674    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  66.67 
 
 		 493 aa  675    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  62.26 
 
 		 481 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  61.84 
 
 		 481 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  66.11 
 
 		 482 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  62.47 
 
 		 478 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  60.67 
 
 		 482 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  59.75 
 
 		 497 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  59.75 
 
 		 497 aa  593  1e-168  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  59.83 
 
 		 479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  59.83 
 
 		 479 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  52.29 
 
 		 477 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  56.81 
 
 		 351 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  53.56 
 
 		 390 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  64.03 
 
 		 334 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  44.79 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  42.26 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  42.26 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  40.59 
 
 		 486 aa  365  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  40.38 
 
 		 486 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  40.38 
 
 		 486 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  41.56 
 
 		 472 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  55.35 
 
 		 275 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  36.76 
 
 		 473 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  69.73 
 
 		 195 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  55.78 
 
 		 251 aa  289  9e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  53.53 
 
 		 249 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  73.61 
 
 		 150 aa  229  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0139  ISPsy6 transposase  79.12 
 
 		 94 aa  150  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0914  hypothetical protein  54.1 
 
 		 124 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770836  normal  0.101303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  24.8 
 
 		 509 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1383  putative transposase or inactivated derivative  24.36 
 
 		 516 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3038  IS4 family transposase  24.36 
 
 		 516 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3052  IS4 family transposase  24.36 
 
 		 516 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 444 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3863  transposase IS4 family protein  28.9 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0534  putative transposase  25 
 
 		 516 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4074  transposase IS4 family protein  29.48 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  27.35 
 
 		 452 aa  124  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0529  putative transposase  24.16 
 
 		 516 aa  123  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  123  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  27.07 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  24.9 
 
 		 444 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  25.4 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  26.8 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  26.8 
 
 		 452 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  28.74 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  27.81 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  27.81 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  26.92 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  27.81 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>