More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3039 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 473 aa  974    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  41.56 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  39.45 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  39.45 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  39.24 
 
 		 486 aa  353  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  39.03 
 
 		 472 aa  343  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  39.03 
 
 		 472 aa  343  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  38.97 
 
 		 482 aa  309  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  37.18 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  36.76 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  35.21 
 
 		 477 aa  296  4e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  36.67 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  36.67 
 
 		 481 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  38.02 
 
 		 493 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  37.81 
 
 		 493 aa  289  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  40.21 
 
 		 478 aa  286  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  35.76 
 
 		 481 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  38.91 
 
 		 479 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  38.91 
 
 		 479 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  35.34 
 
 		 481 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  36.84 
 
 		 482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  37.66 
 
 		 499 aa  273  7e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  39.52 
 
 		 390 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  35.15 
 
 		 497 aa  256  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  35.15 
 
 		 497 aa  256  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  38.41 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  49.17 
 
 		 251 aa  184  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  46.96 
 
 		 195 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  37.89 
 
 		 249 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  48.28 
 
 		 150 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  30.81 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  33.47 
 
 		 275 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  24.31 
 
 		 535 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2397  transposase ISNCY family protein  25 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000732775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  26.15 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  23.94 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  24.3 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  24.5 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  24.85 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  26.48 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  24.3 
 
 		 445 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  26.48 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  26.48 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0139  ISPsy6 transposase  55.95 
 
 		 94 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4867  hypothetical protein  49.48 
 
 		 102 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1571  transposase IS4 family protein  25.1 
 
 		 513 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0160489  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2464  transposase IS4 family protein  23.6 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0786  transposase IS4 family protein  23.6 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.980261  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2272  transposase IS4 family protein  23.6 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0227  transposase IS4 family protein  23.6 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2261  transposase IS4 family protein  23.6 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1576  transposase IS4 family protein  23.6 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0562343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  25.31 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  25.31 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  25.31 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  25.31 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0574  transposase IS4 family protein  23.6 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  95.1  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  95.1  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  23.06 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  22.74 
 
 		 452 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  25.81 
 
 		 458 aa  93.6  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0187  ISCpe5, transposase  23.18 
 
 		 521 aa  93.6  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0485  ISCpe5, transposase  23.18 
 
 		 521 aa  93.6  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165022  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0914  hypothetical protein  43.4 
 
 		 124 aa  93.6  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770836  normal  0.101303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  25.98 
 
 		 460 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  25.98 
 
 		 460 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  25.98 
 
 		 460 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  25.98 
 
 		 460 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>