More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0033 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  84.81 
 
 		 486 aa  845    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  84.81 
 
 		 486 aa  845    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  85.02 
 
 		 486 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  85.38 
 
 		 472 aa  849    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  100 
 
 		 472 aa  984    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  100 
 
 		 472 aa  984    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  44.42 
 
 		 482 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  44.92 
 
 		 493 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  44.7 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  42.65 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  42.86 
 
 		 481 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  42.86 
 
 		 481 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  42.26 
 
 		 478 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  42.02 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  41.6 
 
 		 481 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  44.28 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  43.07 
 
 		 478 aa  360  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  38.03 
 
 		 477 aa  345  8e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  43.13 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  43.13 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  42.71 
 
 		 497 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  42.71 
 
 		 497 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  39.03 
 
 		 473 aa  343  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  38.82 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  42.02 
 
 		 390 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  41.61 
 
 		 334 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  38.04 
 
 		 351 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  47.54 
 
 		 195 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  47.18 
 
 		 251 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  42.15 
 
 		 249 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  38.24 
 
 		 275 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  53.9 
 
 		 150 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0534  putative transposase  26.98 
 
 		 516 aa  146  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1383  putative transposase or inactivated derivative  26.71 
 
 		 516 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3038  IS4 family transposase  26.71 
 
 		 516 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3052  IS4 family transposase  26.71 
 
 		 516 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0529  putative transposase  26.79 
 
 		 516 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  27.43 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  25 
 
 		 517 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  27.25 
 
 		 445 aa  131  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  27.25 
 
 		 445 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 535 aa  130  7.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  31.21 
 
 		 445 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  27.14 
 
 		 444 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3521  transposase  28.27 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3216  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.450921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0251  ISBma2, transposase  28.48 
 
 		 514 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0217  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1524  transposase  28.07 
 
 		 493 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  28.27 
 
 		 493 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2903  transposase  28.27 
 
 		 493 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2662  transposase  28.27 
 
 		 493 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.942406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2953  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.67663  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2740  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0488  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0728  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0457803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1503  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.596952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2227  ISBma2, transposase  28.07 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1715  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1718  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3239  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3291  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0170  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0332  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0878  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1121  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1506  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1804  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1968  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2075  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2116  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0595075  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1522  transposase  28.07 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2248  ISBma2, transposase  28.07 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0026  ISBma2, transposase  28.27 
 
 		 509 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.462908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>