More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3565 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  57.02 
 
 		 482 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  55.98 
 
 		 493 aa  280  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  54.36 
 
 		 481 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  55.56 
 
 		 493 aa  279  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  53.94 
 
 		 481 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  55.19 
 
 		 351 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  53.53 
 
 		 478 aa  277  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  53.81 
 
 		 482 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  53.94 
 
 		 481 aa  275  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  53.94 
 
 		 481 aa  275  6e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  52.7 
 
 		 478 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  53.53 
 
 		 478 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  54.04 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0914  hypothetical protein  98.39 
 
 		 124 aa  255  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770836  normal  0.101303 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 		 497 aa  251  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  50.42 
 
 		 497 aa  251  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  50.41 
 
 		 479 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  50.41 
 
 		 479 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  47.41 
 
 		 477 aa  224  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  44.74 
 
 		 472 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  42.15 
 
 		 472 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  42.15 
 
 		 472 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  59.74 
 
 		 390 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  41.74 
 
 		 499 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  40.87 
 
 		 486 aa  182  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  37.89 
 
 		 473 aa  152  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2405  hypothetical protein  69.44 
 
 		 141 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0594  transposase, IS4  60 
 
 		 78 aa  95.1  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  29.46 
 
 		 535 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1154  transposase IS4 family protein  28.76 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.543034  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  54.69 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  31.38 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  31.38 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  31.38 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  26.5 
 
 		 547 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  27.23 
 
 		 557 aa  68.9  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1113  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  28.16 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2197  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.263222  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6467  transposase IS4 family protein  30.73 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2162  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 482 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0229344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1524  transposase  30.65 
 
 		 493 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  30.05 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  31.18 
 
 		 493 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  30.05 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  30.05 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  30.05 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  26.18 
 
 		 557 aa  66.6  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  34.57 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1274  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 607 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3308  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 607 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204103  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2002  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 607 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2951  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 550 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0779698  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1342  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 538 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0757  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 577 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2829  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 533 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0197  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 538 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1402  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 543 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1301  transposase  30.65 
 
 		 509 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2189  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 518 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2570  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 516 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.647466  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3070  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 524 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.737169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2998  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2779  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 537 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2096  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 522 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1521  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 524 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3220  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 514 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2221  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 545 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0858629  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1600  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1722  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 580 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1138  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 534 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0681  ISBma2, transposase  29.89 
 
 		 541 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2335  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 541 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0367597  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2518  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 539 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1343  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2516  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 522 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.573756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0051  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0082  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0168  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0381  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.653097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2982  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3182  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3216  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.450921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3239  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3291  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3361  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0170  ISBma2, transposase  30.65 
 
 		 487 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>