More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3223 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  68.9 
 
 
460 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  68.94 
 
 
458 aa  644    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  68.9 
 
 
460 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  68.9 
 
 
460 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  68.9 
 
 
460 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
460 aa  946    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  68.9 
 
 
460 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  68.9 
 
 
460 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  68.9 
 
 
460 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  65.71 
 
 
457 aa  623  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  65.71 
 
 
457 aa  623  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  67.11 
 
 
450 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  65.71 
 
 
457 aa  623  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  67.11 
 
 
450 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  65.71 
 
 
457 aa  623  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  67.11 
 
 
450 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  66.3 
 
 
458 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  66.3 
 
 
458 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3878  transposase IS4 family protein  63.83 
 
 
460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.726843 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4079  transposase IS4 family protein  63.83 
 
 
460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0888192 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3682  transposase IS4 family protein  63.83 
 
 
460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399219  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3231  ISPsy22, transposase truncated  59.44 
 
 
248 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0818  transposase and inactivated derivative  71.79 
 
 
224 aa  289  6e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149498  hitchhiker  0.00134243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3060  hypothetical protein  58.25 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979021  normal  0.0493517 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0168  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  33.26 
 
 
487 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0108  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.745289  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0123  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00838697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0217  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0026  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
509 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.462908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0251  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
514 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1114  ISBma2, transposase  33.19 
 
 
510 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1343  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
515 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3521  transposase  33.04 
 
 
482 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0051  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0082  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0381  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.653097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0388  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0426  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0488  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0728  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0457803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1500  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1503  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.596952  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1556  ISBma2, transposase  33.19 
 
 
513 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1715  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1718  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1739  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1742  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0432719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2227  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2278  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000228455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2340  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2362  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2418  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.692381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2563  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2753  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2790  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0388897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2803  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2912  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.199238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2982  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3139  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0516599  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3182  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3216  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.450921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3239  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3291  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3361  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0170  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0332  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0872  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0307509  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0878  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1121  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1506  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1804  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1968  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2075  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2116  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
487 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0595075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3220  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
514 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1376  ISBma2, transposase  33.19 
 
 
505 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0904  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1522  transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1017  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0191  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1737  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1102  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2098  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
497 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579846  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1402  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
543 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2224  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2227  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2248  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0573  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1138  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
534 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0484  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1196  ISBma2, transposase  33.19 
 
 
503 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780467  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0017  ISBma2, transposase  33.19 
 
 
497 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1630  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
498 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1438  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.86843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1480  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1381  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3337  ISBma2, transposase  32.67 
 
 
487 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2522  transposase  33.19 
 
 
497 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.981989  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1050  ISBma2, transposase  33.04 
 
 
493 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000211286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>