More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3682 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4079  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 460 aa  956    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0888192 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3682  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 460 aa  956    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3878  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 460 aa  956    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.726843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  64.41 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  64.41 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  64.41 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  64.41 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  64.41 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  64.41 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  64.41 
 
 		 460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  63.83 
 
 		 460 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  61.32 
 
 		 457 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  61.32 
 
 		 457 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  61.32 
 
 		 457 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  61.32 
 
 		 457 aa  565  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  61.45 
 
 		 458 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  60.75 
 
 		 450 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  60.75 
 
 		 450 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  60.75 
 
 		 450 aa  552  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  58.17 
 
 		 458 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  58.17 
 
 		 458 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3231  ISPsy22, transposase truncated  59.51 
 
 		 248 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0818  transposase and inactivated derivative  68.34 
 
 		 224 aa  274  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149498  hitchhiker  0.00134243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3060  hypothetical protein  52.51 
 
 		 298 aa  226  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979021  normal  0.0493517 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0108  ISBma2, transposase  31.54 
 
 		 493 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.745289  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0168  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  31.54 
 
 		 487 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0176  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1727  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1749  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2843  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2538  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3562  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0191  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2227  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1114  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 510 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1438  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.86843  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2803  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.291213  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1702  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0904  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2252  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2531  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2248  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0484  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0573  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2224  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2300  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1522  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3174  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3527  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1508  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.948339  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1102  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3185  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0988  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171105  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1381  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3102  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2975  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3324  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3398  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1050  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000211286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2064  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1974  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0896  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 523 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1585  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1499  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1275  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2659  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2865  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2908  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.728428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2971  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3046  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3262  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3448  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3017  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3093  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0166963  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3096  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3225  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3391  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1480  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2396  transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0360  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1292  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714124  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2250  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0252  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1023  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1360  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1496  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1649  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221438  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2380  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0738437  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2606  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0243  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1556  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 513 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2366  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2411  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0143  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0132303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1751  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2155  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00375421  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1424  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0315301  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0801  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1017  ISBma2, transposase  31.32 
 
 		 493 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>