More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0927 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  100 
 
 
460 aa  941    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  100 
 
 
460 aa  941    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  68.65 
 
 
458 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  68.65 
 
 
458 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  72.63 
 
 
458 aa  673    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  70 
 
 
450 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  100 
 
 
460 aa  941    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  68.04 
 
 
457 aa  651    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  68.04 
 
 
457 aa  651    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  70 
 
 
450 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  70 
 
 
450 aa  659    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  68.04 
 
 
457 aa  651    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  100 
 
 
460 aa  941    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  100 
 
 
460 aa  941    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  100 
 
 
460 aa  941    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  100 
 
 
460 aa  941    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  68.04 
 
 
457 aa  651    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  68.9 
 
 
460 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3682  transposase IS4 family protein  64.41 
 
 
460 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399219  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3878  transposase IS4 family protein  64.41 
 
 
460 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.726843 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4079  transposase IS4 family protein  64.41 
 
 
460 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0888192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3231  ISPsy22, transposase truncated  62.86 
 
 
248 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0818  transposase and inactivated derivative  72.08 
 
 
224 aa  298  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149498  hitchhiker  0.00134243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3060  hypothetical protein  60.32 
 
 
298 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979021  normal  0.0493517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1293  transposase  61.01 
 
 
244 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164367  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1376  ISBma2, transposase  30.18 
 
 
505 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3337  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
487 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  31.63 
 
 
487 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0108  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
493 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.745289  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3562  transposase  31.4 
 
 
493 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0168  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
487 aa  195  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0176  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1727  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1749  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480253  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2843  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2538  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2662  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.942406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2740  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
487 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2953  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
487 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.67663  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0335  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2087  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0444766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0681  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
541 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3029  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1265  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
487 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1585  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
487 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172447  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2287  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
515 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1496  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0573  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2531  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2522  transposase  30.77 
 
 
497 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.981989  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2224  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1343  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
515 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2570  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
516 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.647466  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2252  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2098  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
497 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579846  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2248  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2227  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0988  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171105  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2096  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
522 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1102  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0904  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0945  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
516 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.867546  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0801  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2366  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1017  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2975  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3324  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3398  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1381  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3521  transposase  30.77 
 
 
482 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0017  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
497 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0896  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
523 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1050  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000211286  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1093  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2411  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0203  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
516 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0243  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0252  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1023  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12442  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1360  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1499  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1649  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.221438  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2033  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
497 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2155  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00375421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2380  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0738437  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3096  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3225  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2903  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3391  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.852283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2396  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0360  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0782  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0917  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
497 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.304514  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1292  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714124  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1722  ISBma2, transposase  30.18 
 
 
580 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2250  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642213  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1737  ISBma2, transposase  30.55 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1522  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1508  transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.948339  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1424  ISBma2, transposase  30.77 
 
 
493 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0315301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>