More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5124 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  67.83 
 
 		 450 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  68.04 
 
 		 460 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  100 
 
 		 457 aa  939    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  72.87 
 
 		 458 aa  696    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  67.83 
 
 		 450 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  68.04 
 
 		 460 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  100 
 
 		 457 aa  939    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  68.04 
 
 		 460 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  100 
 
 		 457 aa  939    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  100 
 
 		 457 aa  939    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  67.83 
 
 		 450 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  73.41 
 
 		 458 aa  691    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  73.41 
 
 		 458 aa  691    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  68.04 
 
 		 460 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  68.04 
 
 		 460 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  68.04 
 
 		 460 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  68.04 
 
 		 460 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  65.71 
 
 		 460 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4079  transposase IS4 family protein  61.32 
 
 		 460 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0888192 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3682  transposase IS4 family protein  61.32 
 
 		 460 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3878  transposase IS4 family protein  61.32 
 
 		 460 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.726843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0818  transposase and inactivated derivative  89.12 
 
 		 224 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149498  hitchhiker  0.00134243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3231  ISPsy22, transposase truncated  64.49 
 
 		 248 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3060  hypothetical protein  62.96 
 
 		 298 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979021  normal  0.0493517 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1293  transposase  62.89 
 
 		 244 aa  203  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  28.9 
 
 		 557 aa  195  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3337  ISBma2, transposase  32.45 
 
 		 487 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2662  transposase  32.45 
 
 		 493 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.942406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2740  ISBma2, transposase  32.15 
 
 		 487 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2953  ISBma2, transposase  32.15 
 
 		 487 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.67663  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0168  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 487 aa  193  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  31.94 
 
 		 487 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2287  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0335  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2087  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0444766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1343  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 515 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0108  ISBma2, transposase  31.99 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.745289  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2903  transposase  31.93 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2843  transposase  32.15 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0176  transposase  32.15 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3029  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1749  transposase  32.15 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480253  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2538  ISBma2, transposase  32.15 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3562  transposase  31.64 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1722  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 580 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3216  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.450921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1727  transposase  32.15 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2002  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 607 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0573  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2531  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2522  transposase  31.93 
 
 		 497 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.981989  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2227  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2643  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 523 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2570  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 516 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.647466  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2252  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0681  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 541 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2248  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1342  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 538 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1737  ISBma2, transposase  31.99 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1522  transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0123  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00838697  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0801  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1424  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0315301  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1017  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3398  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126603  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2098  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 497 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0017  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 497 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0896  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 523 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1114  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1093  ISBma2, transposase  31.99 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1381  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0051  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0082  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0381  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.653097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0388  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0426  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0488  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0728  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0457803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1265  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1500  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1503  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.596952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1585  ISBma2, transposase  31.93 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1715  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1718  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1739  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1742  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0432719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3361  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0170  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0332  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0872  ISBma2, transposase  32.29 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0307509  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0878  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1121  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1506  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1804  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1968  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2075  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2116  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0595075  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1508  transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.948339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2779  ISBma2, transposase  32.23 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1702  transposase  31.93 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>