More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3060 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3060  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.979021  normal  0.0493517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3231  ISPsy22, transposase truncated  65.05 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0557  transposase IS4 family protein  63.49 
 
 		 458 aa  235  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000649319  normal  0.755449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0927  transposase IS4 family protein  60.32 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2267  transposase IS4 family protein  59.11 
 
 		 450 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2276  transposase IS4 family protein  59.11 
 
 		 450 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4639  transposase IS4 family protein  60.32 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0328  transposase IS4 family protein  59.11 
 
 		 450 aa  231  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.127689 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3346  transposase IS4 family protein  60.32 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4611  transposase IS4 family protein  60.32 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.239615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6639  transposase IS4 family protein  60.32 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3057  transposase IS4 family protein  60.32 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8073  transposase IS4 family protein  60.32 
 
 		 460 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4905  IS4 family transposase  62.96 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24611 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5124  IS4 family transposase  62.96 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3050  IS4 family transposase  62.96 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000789979 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2767  IS4 family transposase  62.96 
 
 		 457 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3878  transposase IS4 family protein  52.51 
 
 		 460 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.726843 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4079  transposase IS4 family protein  52.51 
 
 		 460 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0888192 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3682  transposase IS4 family protein  52.51 
 
 		 460 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.399219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3223  transposase, IS4 family protein  58.25 
 
 		 460 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0495  transposase IS1182 family protein  58.73 
 
 		 458 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1054  transposase IS1182 family protein  58.73 
 
 		 458 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.61591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0818  transposase and inactivated derivative  63.5 
 
 		 224 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.149498  hitchhiker  0.00134243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1293  transposase  60.2 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.164367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0153  transposase IS4 family protein  41.41 
 
 		 557 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000196095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1005  transposase IS4 family protein  41.41 
 
 		 557 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.000000370054  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0575  transposase IS4 family protein  41.41 
 
 		 547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000022159  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0168  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2896  transposase  31.91 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0108  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 493 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.745289  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2538  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2779  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 537 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3308  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 607 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.204103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2829  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 533 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0335  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2087  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0444766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2002  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 607 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0681  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 541 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  31.91 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1722  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 580 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2096  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 522 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1521  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 524 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3521  transposase  31.91 
 
 		 482 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0303  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0757  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 577 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3220  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 514 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0197  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 538 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3029  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0051  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0082  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0381  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.653097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0388  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0426  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111451  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0488  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0676  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0728  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0457803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1265  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1500  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1503  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.596952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1585  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1715  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1718  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1739  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1742  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0432719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2227  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2278  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000228455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2340  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2362  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2418  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.692381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2563  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2753  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2790  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0388897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2803  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2912  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.199238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2982  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3139  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0516599  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3182  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0170  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0872  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0307509  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0878  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1121  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1506  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1804  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1968  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2075  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2116  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0595075  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1342  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 538 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0176  transposase  31.91 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0130  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 541 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2951  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 550 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0779698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2516  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 522 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.573756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0154  transposase  31.91 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1274  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 607 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2843  transposase  31.91 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1727  transposase  31.91 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1740  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 518 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1749  transposase  31.91 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.480253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0123  ISBma2, transposase  31.91 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00838697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>