67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2405 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2405  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  292  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  81.94 
 
 		 390 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  69.44 
 
 		 249 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  53.33 
 
 		 478 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  60 
 
 		 482 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  62.69 
 
 		 481 aa  85.5  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  62.69 
 
 		 478 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  64.18 
 
 		 481 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  52 
 
 		 478 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  56.76 
 
 		 493 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  56.76 
 
 		 493 aa  84  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  58.57 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  52.86 
 
 		 482 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  59.7 
 
 		 351 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  50.67 
 
 		 479 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  50.67 
 
 		 479 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  57.81 
 
 		 497 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  57.81 
 
 		 497 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  55.22 
 
 		 481 aa  73.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  55.22 
 
 		 481 aa  73.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  56.25 
 
 		 486 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  48.65 
 
 		 472 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  48.65 
 
 		 472 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  53.03 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  56.9 
 
 		 334 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  52.38 
 
 		 477 aa  63.5  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  34.62 
 
 		 473 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  40.62 
 
 		 499 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3863  transposase IS4 family protein  37.18 
 
 		 440 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4074  transposase IS4 family protein  37.66 
 
 		 440 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  35.62 
 
 		 452 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  34.25 
 
 		 452 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>